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重测序

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在做hic挂载时，运行juicer时出现这三个问题，请问是什么原因以及该怎么解决呢？运行的命令是bash ../juicer/CPU/juicer.sh -d ~/data/hicassembly/hic -s MboI -t 48 -y genome_MboI.txt -z genome.fasta -p genome.chrom.sizes -D ../juicer/CPU

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基因家族分析时，提取cds与pep序列报错

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5 基因组去冗余的选择

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老师我做比较基因组的时候，准备文件阶段时用Ensembl 下载的基因组为什么跑不出来cds和蛋白质文件，跑出来的结果都是0kb，wsl内存也设置了，麻烦老师您再看一下

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MCSCANX查看染色体的时候编号这么多那输出得ctl文件应该怎么设置

  • 李 2023-11-29 15:27
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circos 分析

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call snp

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windows系统docker 上传镜像时出现 context deadline exceeded怎么解决

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筛选不到串联重复基因

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没有 easySFS.py

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请问为什么显示打不开这个文件

  • 李 2023-11-01 18:09
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PASA预测基因数目过少

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老师运行“ls aln_out/*.cds_aln.fasta |while read a;do sed -r 's/([A-Za-z]+_[A-Za-z]+)_.*/\1/g' $a > $a.renamed;done”后得到的结果single_copy.cds_msa.fasta是空的文件夹是空的，但是提取pep序列运行是正确的，这怎么解决呀

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求助，扩增子测在OTU分析时，这一步报错~

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为什么在输入完保留蛋白编码基因后变成了这样，然后哪个命令是回到文件

  • 2023-10-31 15:17
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cytoscape替换ID报错

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本地blast出现问题

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16S FastMap文件如何填写能否像详细讲解一下，视频中说tap1文件就是ckd就是肾病患者的简称填写吗，我搜到的是tap列通常用于记录与每个样品关联的分类工具或方法的信息。像这样，能否详细说明一下

  • 2024-02-23 11:46
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基因家族鉴定数据准备

  • nuli 2024-01-05 11:47