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非模式物种建库进行GO和KEGG富集分析

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不同组扩增子数据长度差距太大，如果一起分析是不是结果不太好，分别分析然后编程整理是不是比较好一点，还是舍弃差距过大的数据呢？

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gene-family:v2.0中的blast软件版本

  • 2023-12-13 14:35
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gatk call snp生成的vcf想要打开查看，提示是二进制文件？看不到变异信息 请问哪里出问题了吗？

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老师，这怎么解决

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下载docker是出现这个问题

  • 李 2024-06-21 15:52
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单细胞测序数据分析#相同细胞不同处理之间差异B细胞差异时报错

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请问如果我先对蓖麻，拟南芥等的CDPK基因家族做了blast分析，找出了蓖麻中的CDPK基因，还用进行那些hmmer分析什么的吗

  • 李 2023-11-15 01:44
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群体遗传SNP获取

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请问用相同的文件，只是把名字改了一下，然后docker自动把重复的序列删除后，为什么出来的motif不一样啊，然后我又把名字改成不一样的，让他不能过滤掉重复序列，之后生成的就和之前的一样了，是什么回事

  • 李 2024-01-11 11:07
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安装 velocyto 报错

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循环

  • Jay 2024-01-13 16:15
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您好！我是R语言的新手，在用hchinamap程序绘制地图时，出现cannot coerce type 'closure' to vector of type 'character'，出现这类错误怎样解决呢？请指教，谢谢！

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gatk VariantFiltration这一步的过滤，我看到gatk 官网上SNP和indel的过滤条件有点不一样。是否可以把SNP和indel从all.raw.vcf.gz提取出来个各自硬过滤后再合并做后面的分析？

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老师用你们基因组注释的镜像和脚本进行EGGNOG注释一直提示里面没有tidyverse这个R包，请问应该如何解决。

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单细胞测序数据分析时，修改seurat对象的Idents，并添加细胞类型信息到metadata中，并增加mycelltype列时，增加不上

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GWAS脚本中的$PATH为什么脚本运行会报错

  • Jay 2024-03-19 21:28
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GWAS中gapit分析没有结果，命令行输入与屏幕输出如下

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mcscanX能否用于动物基因组内基因家族的共线性分析？

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我想问一下从公司获得测序数据如果是以下的cleandata，我们是否从章节2课时6看起就可以了呢，是否向需要进一步质控？