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mcsanx作图问题

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泛基因家族 提取CDS序列和pep序列 跑了很久之后，显示没有权限

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基因组间共线性分析作图问题

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老师 你们这里给的是不是有一些代码没有 ，我就是按照你们给的元宝枫的数据和代码一步一步做的 花式出现下面的错误

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iqtree2不报错，自动停止运行。

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5 泛基因家族docker报错

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请问这是怎么情况呀？

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T2T基因组组装和注释18步

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数据质量查看遇到问题，后续，代码又试了没问题，但是好像缺了什么插件，请老师帮忙

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omicsclass/pan-genome:v1.1镜像OrthoFinder.py报错

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为什么在做进化树分析的时候，有的文章使用19条蛋白序列而有的文章是20条（同一个物种，同样的蛋白）？

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为什么vcf文件根据不同参数过滤后保留163138个位点但最终LM和LMM进行关联时却只有102296个snp位点？

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liftoff 运行失败

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20 用enrichGSEA和用官方GSEA软件跑出的多条通路都是相反的，是为什么呢

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3 我按照视频里的方法用deblur的方法进行分析，输入了51个样本，但是最后就剩下了35个样本，如图所示，请问是那一步出现错误了，是 数据有问题还是写的参数有问题

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老师，我的db文件夹里显示了所有染色体都已经导入，但是在将gvcf转换成vcf时，发现在Lc2Ns染色体就结束完成了，这是正常现象嘛，是我使用的近源种参考基因组的原因嘛？我的是简化基因组测序的

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T2T基因组组装与注释17步

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扩增子分析结果的差异显著性的p值在哪里找到

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fasttree 建树时没有找到这个软件

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seqclean出错