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5 docker打不开镜像

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binning功能注释

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泛基因组核心基因和可变基因长度比较core_pan_gene_compare.r报错

  • Q_C 2024-12-02 18:46
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docker 安装失败

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已经windows系统里下载了docker 也打开了，但还是运行不了. doc.sh

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单倍型分析

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老师您好，使用beagle进行基因型填充的时候参考文件放在哪里呀，课堂上的实例是水稻的，但是我做的是人类的，需要修改哪里吗

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老师您好，在做连锁不平衡分析的时候出现这样的结果要怎么解决啊

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5 新手小白，刚开始学习docker，想问一下，做泛基因家族分析最开始，怎么将老师服务器中使用的加载环境变量用到的env.sh（还有老师课程中一些其他必须要用到脚本）粘贴到docker中呢

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在运行core_pan_gene_curve.r的时候报错

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5 could not find function "newCountDataSet"运行deseq_analysis.r这个脚本报错

  • 荣 2024-12-12 16:45
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清理内存后发现，docker运行不了了

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GWAS分析

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老师您好，做GWAS分析使用GLM模型时，p值为什么都是-0啊？

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Doker打不开，显示内存不够，电脑还有100G内存: don't have enough memory

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老师您好，下载镜像失败显示这个该怎么解决？

  • BJFU 2024-11-26 16:44
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老师您好，在做GWAS分析的时候，性状数据不是连续的数字，是0，1这种，这样的数据也可以按照上课讲的流程分析吗？性状数据没有多年数据，在后续的分析步骤中，不定义tassel_trait这个变量可以吗？

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20 请教一下TCGA的蛋白数据怎么理解，它是有正负值的，这个正负值代表什么意思，为什么蛋白表达会有负值？我只想给它分成高表达，低表达和表达缺失组应该怎么处理呀？

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hifi组装和ont组装n50小了十倍正常吗？

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老师们好，在生成gvcf文件合并vcf文件时，出现这种警告信息，请问是什么原因，如何处理啊？