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3 建立进化树

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5 老师您好，您之前的文章有一篇《TCGA临床数据各列含义》，有一部分临床数据找不到，请问有没有官方文档可以找到全部临床数据各列含义？

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30 我买了转录组分析的课程，在运行fpkm_and_plot.R脚本时提示Error in library("getopt") : there is no package called ‘getopt’ Execution halted， 我打开R语言安装getopt后仍然显示报错，请教各位大神和组学讲堂的老师

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5 MCScan画图每条染色体不同颜色

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5 circos 字体大小与比例问题

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20 老师您好！我想请教您关于土壤微生物分子网络构建的问题。我的实验材料是某一林地四个季节的土壤样本，每季节三个重复，三个重复样本能用conet构建网络吗？如果不可以，可以用四个季节的样本（12个样本）放一起做网络吗？这样合理吗（要怎么解释这个网络）？谢谢！

  • 2021-11-18 12:23
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5 老师，我在运行MCSCANX查找共线性时，为什么显示没有结果呢？

  • 2021-11-16 13:19
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3 为何我研究的物种设计snp引物时，输出引物文件的excel是空的

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5 请问，首次使用MCscan (Python version)可视化作图时，没有mcscan_seqids和mcscan_layout文件，该怎么创建这两个配置文件呢？自己创建的配置文件运行后，结果文件有问题

  • 2021-11-13 18:34
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3 老师，我在运行MCSCANX查找共线性时，出现以下情况怎么解决啊？我的mcscanx软件已经成功安装在了biosoft中啊，

  • 2021-11-10 21:56
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5 老师，我利用linux运行mcscanx时一直提示以下错误，怎么解决啊？

  • 2021-11-09 15:21
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5 生信小白，求教基因组共线性分析报错问题（如图），请问是什么原因呢

  • 2021-11-09 14:12
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10 TCGA用R数据下载错误

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5 老师，您有没有mcscanx的压缩包文件啊，我网站打不开

  • 2021-11-04 23:40
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5 老师，我安装mcscanx软件时打开所给网址显示有错误怎么下载啊？

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10 转录组与转录组之间所有序列进行两两比对

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3 老师，想请教一下TCGA基因表达数据的问题，我从xena.ucsc网页上下载了基因表达数据TCGA-CESC.htseq_counts.tsv；然后发现该数据中只有Ensembl格式的基因ID ，没有SYMBOL格式的。所以接下来进行基因ID格式转换，却发现同一个SYMBOL ID对应的多个Ensembl格式的ID，想问下老师，这种情况该怎么处理？同一个SYMBOL ID所对应的多个Ensembl格式ID的基因表达数据应该留下哪一个？

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5 老师，我做基因上游顺势作用元件分析时出现这种情况是什么意思啊？

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3 老师，请教您一个生存分析的问题，为什么phenotype的删失数据天数一列中会出现alive time=0的情况,是病人还没开始实验观察就去世了吗？

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3 生存分析：老师,我看到了这个生存分析的代码在利用索引定义一个新的向量时先定义了一个,想请教一下您他为什么刚开始要定义一个纯0向量呢,先谢谢您啦