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5 TCGA生存分析报错

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5 TCGA-基因差异表达分析课程中您写的perl脚本如何运行？

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5 老师，您好。我初次接触网络图。目前遇到一些问题还望得到您的帮助。在R中生成gml文件时先运行pattern<-co_occurrence_network(Abu,0.6,0.01)。但出现了Error in V<-(*tmp*, value = *vtmp*) : invalid indexing的错误，我查过一些资料不过没太搞懂。下面是我用到的表格，应该是表格的问题，但对比例表并没有差异。

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5 atacseq测的是RNA还是DNA，和chipseq有什么区别呢？

  • 2018-09-14 22:16
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5 老师您好：关于TCGA的生存分析，用训练集train来做单因素的生存分析筛选有意义的基因，为什么在鲁棒性分析的时候不用训练集，而是整个数据集exprSet呢？

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5 老师，您好！我找不到MEME分析perl脚本，请求帮助！

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5 三代无参全长转录组做基因家族进化树分析时发现有多条序列的蛋白序列相同，有必要删除相同序列吗？

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5 请问一下，当用时期作为表型数据时，文件该是什么格式？行和列各怎么赋值，还有就是重复间要不要区分？

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5 WGCNA分析中，取材是，有5个植物发育时间点，两个品质高低不同的材料，三次生物学重复，也就是三十个样本，请问，针对其中某个材料某个时间点中的一次生物学重复不好的剔除后，影响WGCNA的分析吗？还有就是时间点可以作为一种表型作为输入文件吗？

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5 如何查询hmmer 版本？

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5 请问 biolinux 到这步输入密码的时候，键盘无法键入字母了那？

  • 2018-09-11 20:33
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5 我一直有一个问题，小麦在做家族鉴定时会有好几个转录本(如.1，.2，.3等)，这时候是只取.1呢，还是所有转录本都取？

  • 2018-09-11 18:57
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5 TB-tools打不开

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5 计算基因kaks时，axt文件序列末尾已删除多余和gap，但运行命令时仍报错(not equal)，为什么？

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5 关于Itol使用

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5 进化树序列名称如何更改

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5 老师您好，我在用conet对自己数据分析时，总是报错。

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5 做Itraq或TMT蛋白定量分析,植物叶片需要最少多少组织样品?

  • 2018-09-06 13:03
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5 我是新手，想问问各位前辈怎么下载水稻和拟南芥的SBP基因家族，不会具体下载步骤

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5 WGCNA分析中，β值未达到0.8，计算机给出的β估计值为1，我觉得不是很合理，想取β值=0.7对应的n值（如图2所示，n=21），这样可行么？