1 回答

3 docker镜像加速后，下载你们的gwas镜像时，总是pull了一半，剩下的立刻就没反应了，尝试了几十次，这个怎么回事，

1 回答

10 尊敬老师，根据重测序课程质控的时候，有的样本会killed，有的就不会，killed的输出结果文件也不是空的是什么问题呢？别的样本数据可以正常输出，这三个文件都特别大，双端测序总共能有20G，是不是数据太大，内存不够

1 回答

5 qtlseq分析问题：用github上的qtlseq分析代码，在作图这一步就出现了问题

  • kid 2023-06-16 10:22
1 回答

30 请问在重测序数据比对参考基因组时，参考基因组中除chr外还含有contig，是否需要对contig进行去除。之前在比对时将contig也一块比对了，对后续的变异检测有没有影响？

1 解决

100 docker运行qiime1时按照教程进行到章节2课时6时，即聚类生成OTU-denovo时老是报错，查看类似问题后，升级了运行内存为70g，同时将教程内的30多个样本减成2个样本，FASTQ格式还有qimme格式检查都正确，依旧报错，报错内容如下：Segmentation fault

1 回答

15 您好，三代全长转录组无参测序，昆虫前后2次取样，第2次雄昆虫测的数据量是第一次雌昆虫的2倍，最后得到转录本是第1次的2倍。这个结果怎么解释啊？

1 回答

5 使用allhic挂载染色体时，长度排序前十的超长contig只有一个挂载到group中，如何将这些未挂载的超长contig也绘制到heatmap图中

1 解决

10 尊敬的老师，在按照咱们课程进行选择消除分析 fst pi ROD时，可以正常输出pi.wild，为什么画图的时候图为空的，是不是数据有问题，我的数据是真菌的，fai文件只有1kb，

1 回答

10 尊敬的老师！！恳请您在百忙中帮忙解答！根据群体遗传进化课程我构建进化树，显示如下错误。我的VCF文件通过如下命令进行排序，。排序后VCF文件缩小了很多，是对的吗？是不是我的vcf文件有问题，但是我PCA和STRUCTURE都是可以分析的，急需亲爱的老师们解答！！！

1 回答

3 MCScanX分析时 transcript_id与基因组蛋白序列ID不一致，不能获得对应的.pep文件

1 回答

10 MCScanX 共线性区域太少

1 回答

5 小白刚开始学，请问这是为什么，做了好几天了还是不知道怎么做，恳求指导谢谢

5 回答

10 使用ALLHIC流程只挂载出了一条染色体

0 回答

10 按着课程做，用的也是组学的数据，KEGG富集分析，只生成normal_vs_tumor_degene.id.map.tsv文件

1 回答

10 3D-DNA挂载的染色体如何chain文件

0 回答

5 老师您好，MEGAX构建进化树的时候弹出这个窗口是什么意思，要怎么调整我的序列？

  • 2023-04-30 02:23
1 回答

20 mysql镜像启动问题

1 回答

5 请教一下，基因组hifi数据组装可不可以用一个近缘品种的Hi-C数据进行辅助拼装和染色体挂载

2 回答

3 老师，您好，我们是做忙果基因家族分析的，用的是linux（用拟南芥的数据我们都能做出结果），但忙果注释文件gff总是报错，对我们学农的来说，对脚本真是一窍不通啊，根本不知道该怎么修改，老师叫我们把gff文件改成拟南芥的格式，用linux做，我们的基因id，mRNAid，蛋白id都是不一样的，我们想都改成与基因id一致的，我该怎么改啊，老师可以帮忙看看文件吗

0 回答

10 非模式物种eggnog 批量注释，输出的pep.fa没有内容

  • 2023-04-05 15:06