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T2T基因组组装与注释第18步

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HiC-Pro使用

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进行metastat分析时报错

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老师我已经用gemma找到了显著位点，现在想将两位点之间连锁不平衡程度r方大于0.35，且标记之间距离在300KB以内整合成一个qtl，应该用什么命令啊？

  • WHR 2024-08-15 12:30
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扩增子分析结果的差异显著性的p值在哪里找到

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老师，HGMD链接失效了，可以再分享一下HGMD数据库的信息吗？

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基因组注释Braker里面的报错

  • 2024-08-12 21:27
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老师，您能给找找这几种杜鹃的genome.fasta和gff3文件吗，我找到的文件在提取cds和pep的时候，一直是错误的。

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R语言下载GSE数据一直在报错

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老师 我想问一下 怎么把做出来的圈图上面的染色体按照chr1-13 这种顺序排列啊 不是下面第一种排法，而是第二种排法 按照顺序排列的

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过滤后的vcf文件怎么把标记划分为八种分离类型（ab × cd、ef × eg、hk × hk、lm × ll、nn × np、aa × bb、ab × cc 和 cc × ab）？

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RNA-seq课程中的初始数据来源于哪篇文章

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老师，请教一下，重测序时对bam文件排序出现问题，提示Exception in thread "main" java.lang.RuntimeException: Invalid lookback distance found.怎么解决呀

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感兴趣的区域LD热图不包括indel位点？

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我的差异基因是mstrg 开头的，然后做分析的时候这些基因转换不上去

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单倍型分析报错

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15 有老师知道为什么TBtools的图是黑的呢？

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为什么我出来的基因是67个，kaks图出来的却这么少呀？

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请问老师，泛基因家族的数量是根据什么定的啊，如果说几个基因组共有的加上单个基因组独有的话，怎么还会有的基因不存在任何一个基因组呢？