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基因组gff3文件中mran parentID与gene ID不对应，应该怎么做？

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老师 问一下 我这是pep蛋白文件 但这个文件开头用的不是转录本ID 如何将转录本ID 放在第一列 不然得不到对应基因的蛋白质序列

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ImportError: liblapack.so.3: cannot open shared object file: No such file or directory

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请问谁有Ai的免费安装包，之前下载的打不开，谢谢了

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请问裸子植物的全基因组在哪里可以下载

  • 2021-10-28 11:06
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老师您好，我在导入虚拟电脑时出现错误，返回代码：E_INVALIDARG(0x80070057),请问这个怎么解决，谢谢老师

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5 老师，我安装mcscanx软件时打开所给网址显示有错误怎么下载啊？

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10 转录组与转录组之间所有序列进行两两比对

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3 老师，想请教一下TCGA基因表达数据的问题，我从xena.ucsc网页上下载了基因表达数据TCGA-CESC.htseq_counts.tsv；然后发现该数据中只有Ensembl格式的基因ID ，没有SYMBOL格式的。所以接下来进行基因ID格式转换，却发现同一个SYMBOL ID对应的多个Ensembl格式的ID，想问下老师，这种情况该怎么处理？同一个SYMBOL ID所对应的多个Ensembl格式ID的基因表达数据应该留下哪一个？

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5 老师，我做基因上游顺势作用元件分析时出现这种情况是什么意思啊？

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做WGCNA分析，性状数据可以同时有数量数据和分类数据吗？

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3 老师，请教您一个生存分析的问题，为什么phenotype的删失数据天数一列中会出现alive time=0的情况,是病人还没开始实验观察就去世了吗？

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关于用Perl脚本进行同源基因正选择分析

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3 生存分析：老师,我看到了这个生存分析的代码在利用索引定义一个新的向量时先定义了一个,想请教一下您他为什么刚开始要定义一个纯0向量呢,先谢谢您啦

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5 筛选差异分析基因的时候上调下调基因数量差别太大正常吗？

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10 TCGA的RNA-seq count annotation过滤，有些不知道是否需要删除

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老师您好，看了您的《pacbio 三代全长转录组数据分析流程 Iso-Seq 3》文章，想请教一个问题

  • 智 2021-10-18 17:08
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你好，我用get_mRNA_position.pl提取获得AT.gff文件是空文件，全程没有报错

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您好,qtlseq可以运行,麻烦看一下结果,阈值为什么都不是线而是点

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老师您好，学生出现了和您一样的问题，wgcna模块是一个颜色，特请教老师您的解决办法，很抱歉在白忙之中打扰到您