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10 大家好，我想问一下，做进化树分析，想把一些文件从一个文件夹cp到新建的进化树的文件夹，但是cp的时候说找不到这些文件，但这些文件就在哪里，不知道这是什么原因呢，直接复制粘贴过去也不太行，在终端里ll一下依旧找不到。

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老师，请问我如何操作这4个exl才能得到完整的像课程中的一个VCF？直接复制粘贴exl到一个txt？

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想问一下泛基因组分析时，基因家族的鉴定中选择a个物种；SV分析是文章中构建的b个物种中的；转录组分析是c个物种中的；请问a受b，c的影响吗？a：能不能我找到13个基因组就在13个基因组里面分析呢？而b和c是文章中找到的，利用人家的数据分析自己的基因，这样的理解对吗？

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想问一下泛基因集的构建，如果有相关参考文献有泛基因组的构建是不是我就不用学习这部分内容了；想问一下什么情况下才需要构建泛基因集？构建泛基因集的目的是什么？

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想问一下，为什么我用pfam筛选，结果出来是这样的，没有能看结果的地方，也没有能下载的地方

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老师，我看课程里有这一步，但没讲解后面的C是干什么的，也看不太清C前面上角那个符号是打的啥怎么打上去的

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请问我想注释出碳氮磷硫功能基因及丰度，有什么教程吗

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老师，请问在做结构变异分析的时候找到了与VCF文件相似的多个EXCL文件，请问这种情况怎么办？将excel文件后缀改成VCF文件？

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treemix

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老师，我想问一下，我正在学泛基因家族分析；自己的数据如何上传？是弄成压缩包的形式通过filezilla上传到data文件夹，覆盖之前上传的课程内容吗？

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想问一下视频课程里的data内容换成自己的数据就行了嘛？

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第一张图片为smart，没有查询到结构域。第二张图片为interpro，共有135条序列，最后显示结果为118。图3为CDsearch查询结果，为135条。最终形成的新的IDlist是不是以interpro为准，118个ID

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5 gatk变异检测

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拟时序分析分化方向和实际不相符合

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5 请问泛基因家族分析实操课程中老师用到的泛基因列表为什么和课程泛基因集构建得到的列表不一样呢？

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xpclr计算

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做基因家族，需要下载图片中哪些文件？Genome Gff CDS Protein dou都需要下载吗

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泛基因家族，PAV分析提取id列表，确实一个基因组的信息，只统计了RH10-15，忽略了RH

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请问跟着教程做的时候，无法下载omicsclass/reseq:v1.1，老师您能提供一份在线下载链接吗？

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docker在电脑上安装不上