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在菠萝那篇文章里验证基因预测是否正确时，对不能用转录组数据比对回去的基因进行PCR验证，因为我不是学生物的，对PCR不了解，想问一下它是对那段基因的DNA进行扩增的吗？那段DNA是可以根据预测的序列人工制造出来吗？PCR扩增什么时候可以扩增出来什么时候扩增不出来呢？怎么就能验证基因的是否真的存在呢？

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10 get_gene_exon_from_gff.pl 这个脚本提取不出CDS信息，无法绘制基因结构图

  • 2019-10-09 11:02
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circos不能正常生成配置文件

  • zhoy 2019-10-09 00:22
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10 老师您好，我想利用gff文件和fa文件提取cds序列，请问应考虑哪些问题呢

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请问GO富集文件gene2go和go2gene之间怎么转换？

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MCScanX共线性分析，请问linux报错怎么解决？

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3 pacbio转录组数据处理

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虚拟机安装报错

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老师，您好，在学习样品与OTU二分网络图的绘制中，导入Cytoscape中的文件ewight值是如何计算的？

  • 2019-10-07 13:29
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基因共线性blast出现warning警告提示

  • ollo 2019-10-07 12:26
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Blast分析筛选不到串联重复基因

  • zhoy 2019-10-06 18:13
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关于鉴定基因家族成员

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5 我在运行MCScanX时报错，以下是我的输入文件和报错截图

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KaKs问题，想问一下，有没有关于单子叶植物突变速率相关的文章，谢谢老师

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我做了重测序，进行了变异检测，有没有相关类型的文章可以借鉴借鉴！

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5 使用bio-linux中sratoolkit里prefetch下载数据，但是无法打开试过用自带的sratoolkit，也自己去下了个最新版的放在用户文件夹也不行，我按照网上的教程设置环境变量，用source ～/.zshrc使配置生效了（好像bio-linux用bashrc不行？），但是无论如何也打不开，不知道哪里出了问题，有大佬知道吗，小白实在不懂

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关于mcscan问题

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基因共线性

  • ollo 2019-10-05 12:37
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老师我做了三对黄黑仔的二代重测序，然后做了变异性检测，我没有这类相关的文章可以借鉴借鉴！

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基因家族分析文章：筛选时为什么选用基因组数据库的编码蛋白，而不是蛋白组数据库？

  • 2019-10-04 16:38