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老师好,我想问一下自己找公司测序得到的GB文件和fasta的文件跟NCBI上下载的需要做一个统一化处理吗?如果要做的话,需要采用哪种方法?因为我发现他们注释的基因顺序不太一样,所以就担心对后期的分析有影响。(比如说特征统计分析,密码子偏好性分析,IR区边界分析,重复序列分析,结构变异分析,序列多态性分析,系统发育分析,分子标记开发等)
天幕星
2023-09-17 19:47
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安装docker 进行16S分析物种注释过程很慢
16S
qiime2
zoeZHT
2023-09-17 18:59
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quickmerge合并多个软件组装的基因组后,使用nextpolish去polish基因组,得到的结果的N50比打磨前的低是正常的吗?基因组由549M打磨到了531M,总的contig条数没变,N50都是N=3.
单恋一枝花
2023-09-17 13:16
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比较基因组学分歧时间脚本
Helloeva
2023-09-16 18:55
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GWAS分析中的PCA绘图识别不出来R脚本
PCA
231
2023-09-16 11:34
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老师好,我在跟着课程实操时,运行gatk call snp时候,使用源代码也报错了,我用的镜像是课程里的v1.1的版本还请老师帮忙看看,谢谢了!
宇宙菠萝包
2023-09-16 10:59
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请教老师,Gemma分析时的报错问题?
GEMMA
LU
2023-09-16 01:03
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做群体进化和GWAS的R版本
版本
231
2023-09-15 20:22
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是否有利用paml中codeml计算正选择和快速进化基因的教程?
暴雨
2023-09-15 15:20
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老师您好,promoter.fa导出为空,是什么原因呢
siu
2023-09-15 13:24
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基因组重测序,read比对到参考基因组时出现truncated file怎么办
reads比对
2023-09-14 23:09
1
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构建系统进化树
进化树
tassel
231
2023-09-14 16:34
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Tassel进行自己的GWAS分析中,自动分析pca时,不生成pca1~3文件
tassel
GWAS
PCA
993
2023-09-14 15:41
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1585
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老师,cp文件报错怎么解决
基因家族
江月
2023-09-14 01:55
1
回答
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老师,你好。orthofinder运行是出现too many values to unpack问题怎么解决
2023-09-14 00:08
1
回答
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admixture进行K值循环时,输出文件admixture.log$k.out只有1kb
993
2023-09-13 21:56
1
回答
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请问QQ图绘制时报错,文件明明在,却找不到文件怎么回事啊?
qqman
LU
2023-09-13 21:43
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回答
1294
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老师,您好,我按照课程执行重测序里面的变异结果统计与绘图,其中indel可以正常执行,但是snp运算没有结果,请问老师是什么原因呢?
SNP
叶雪儿
2023-09-13 15:12
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回答
907
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F2人工群体进行GWAS分析表型数据处理?
表型
231
2023-09-13 11:13
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请教GEMMA安装报错怎么解决?
GEMMA
LU
2023-09-13 10:22
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