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在群体遗传学的分析中，通常会计算核苷酸多样性。一般是以滑动窗格的形式展示的pi值，但是在文章里通常会展示一个整体的pi值，这个整体pi值通常是怎么计算呢？

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docker进行RNAseq分析，GO和KEGG聚类分析获得气泡和柱形图，镜像启动都正常，但是运行四步代码全部如下报错

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老师，您好，RNAseq分析中，进行PCA分析时，为什么会有如下的报错，是给的R的脚本哪里出问题了吗？

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3 各位老师，想请问一下注释文件Gb格式如何转化成Gff格式呢？

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iqtree2 -s supergene.phy -st DNA -T 2 -mem 8G \ -m GTR -redo \ -B 1000 -bnni \ --prefix iqtree 命令怎么加入外类群分析

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基因家族表达量热图的时候没有找到合适的FPKM文件

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老师，你好，请问群体遗传学，用提供的代码计算LD，生成图时，为什么会有如下的报错？并且不能生成图，谢谢

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做物种间共线性分析时报错，这是因为什么

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MCScanX运行无结果

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老师，我看您之前分享过一个HGMD数据库的下载链接，但是现在似乎失效了，请问能再次分享一下吗？

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比较基因组学NCBI数据提取CDS失败

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10 做真菌有参转录组测序，mapping值很低。

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10 老师您好，我想请问我的种源地不知道，做完群体遗传，从进化上看看群体材料的差别，然后能做候选基因的功能分析吗？，我想把全基因组重测序和代谢组关联起来，然后找到候选基因功能验证，请问这个可以吗？谢谢老师的解答

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iqtree2 -s supergene.phy -st DNA -T 2 -mem 8G -m MFP+ASC -redo -B 1000 -bnni --prefix iqtree 出现报错

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NCBI上下载的CDS序列的ID和GFF文件的ID对不上，导致CDS提取失败怎么办

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比较基因组，无法获得pep和cds序列

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iqtree 分析需要ASC矫正嘛？

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gatk callSNP 和bcftools call snp 哪个会更好一些，bcftools得到的 all raw vcf.gz ,也是使用4.snp_indel的过滤1/2/3 步骤进行过滤嘛？ 过滤1：gatk VariantFiltration过滤2：vcfutils.pl过滤3：vcftools。

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run_pipeline.pl -Xmx30G -importGuess all.clean.vcf.gz -ExportPlugin -saveAs supergene.phy -format Phylip_Inter 做iqtree分析的时候，转换文件格式报错

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基因芯片探针与基因ID转化

  • ZLX 2023-07-29 16:31