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seqclean出错
小文
2024-10-28 19:19
1
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346
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图1是用命令查询了,图2就是遇到的问题,文件始终显示无法启动传输,但有几个已经传输成功了
不如
2024-10-28 18:28
2
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381
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07.SV_and_gene_expression中删除一些不需要的基因的表达量后文件是空的
树心台
2024-10-28 17:01
0
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260
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运行MCScanX-transposed计算kaks是出现以下情况
汤倩华
2024-10-28 14:01
2
回答
377
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在filezilla里,将硬盘里的数据拖进自己建立的文件夹是总是传输不成功,是什么qingkuang
不如
2024-10-27 20:16
2
回答
368
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03.PAV 提取物种独有的家族基因时,出现killed ,不能进行代码操作
乌鱼便当
2024-10-27 20:00
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deblur生成featrue-table出现错误
16S
qiime2
deblur
云海
2024-10-27 11:26
1
回答
236
浏览
找不到课程对应的代码文件
找不到代码文件
jiakfy
2024-10-25 23:25
2
回答
454
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遗传图谱构建
view可视化
Chen jie yang xi rêve
2024-10-25 21:23
1
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309
浏览
老师,在生成gbcf文件后,发现只运行了前三个染色体的,是我的代码有问题嘛?该怎么解决啊?参考基因组的fasta,fai文件都是好的,前期生成的bam文件也是好的,样品是四倍体,参考基因组是异源四倍体
gvcf
bam
啊呀。
2024-10-25 18:12
1
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不能使用scripts中的vcf2map.pl脚本
Chen jie yang xi rêve
2024-10-25 16:17
1
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465
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老师,我的db文件夹里显示了所有染色体都已经导入,但是在将gvcf转换成vcf时,发现在Lc2Ns染色体就结束完成了,这是正常现象嘛,是我使用的近源种参考基因组的原因嘛?我的是简化基因组测序的
VCF
gvcf
db
啊呀。
2024-10-24 23:55
0
回答
379
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SNP分析软件SNPT最小SNP分析结果疑问
SNPT
SNP
三行
2024-10-23 16:12
0
回答
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20
用enrichGSEA和用官方GSEA软件跑出的多条通路都是相反的,是为什么呢
单细胞测序
Liu Yan
2024-10-23 15:44
2
回答
463
浏览
老师,问题比较复杂,麻烦您看一下详细的问题描述,小麦基因组
gvcf
db
啊呀。
2024-10-22 12:08
1
回答
412
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linux里不能通过 sudo docker pull omicsclass/samtools:latest,显示连接超时
docker
联系客服
浦东公鸡
2024-10-21 21:59
2
回答
446
浏览
fasttree 建树时没有找到这个软件
进化树
随风
2024-10-21 16:50
1
回答
427
浏览
老师,我有141个样品,现在IndexFeatureFile,tabix,bcftools都无法成功构建gvcf的索引,只有CSI格式能成功索引,这个格式在后续也用不了,这个gvcf索引还有其他的解决办法嘛,还是说我只能重新生成vcf文件了
gvcf
啊呀。
2024-10-21 16:30
1
回答
379
浏览
老师 就是质控出来的好多个个体的这个部分Per base sequence content都出现以下这种情况 这种是不是不行啊
烟雨易冷
2024-10-21 16:15
2
回答
521
浏览
老师,您好,我在运行gatk的HaplotypeCaller时,因为样本过多(二三百个样本),运行成功的单个样本运行了24+个小时,尝试了采用ParaFly工具多任务并行,并且也尝试了同时运行多个nohup sh gatk.g.sh > gatk.g.sh.o&(一个gatk.g.sh对应一个样本),但是都是在十几分钟后终止进程了,查看了其中一个gatk.g.sh.o文件,文件内容如下,烦请老师帮忙提出问题及解决方法,非常感谢
GATK call SNP
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2024-10-21 15:59
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