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群体结构分析

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10 关于TajimaD的筛选问题

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关于TajimaD计算问题

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请问老师如何看选择清除分析中的选择信号值？怎么判断受选择基因的选择强弱？从基因列表中只能获得基因的位置等信息。

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群体遗传PCA分析报错

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群体遗传进化中合并候选基因区间失败，文件是bed格式，麻烦老师解答

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SNP过滤de问题

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自己电脑的docker image镜像如何共享到服务器的docker中

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PopLDdecay计算LD，计算后画出的曲线没那么平滑，波动较大，应该怎么处理？如何确定该群体的衰减距离？谢谢

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做群体遗传分析，需要把indel提取出来嘛只用SNP的vcf文件？

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GWAS课程中LD分析使用示例数据一直做不出来，检查很久都没有解决问题，麻烦老师进行解答。

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PSMC 作图问题

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群体遗传PSMC问题

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群体遗传进化课程中基于pi用R脚本绘制曼哈顿图请问更改色板颜色的具体指令

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群体遗传课程fasttree建树问题

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5 我手里有老师给的700＋水稻品种，这700＋品种重测序结果直接从水稻3K里down下来的，请问可以用来做遗传群体进化分析吗？

  • 2023-11-14 15:42
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启动镜像docker失败

  • ruth 2023-11-14 14:15
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structure_plot.r: command not found

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群体结构分析计算最佳K值出现问题

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Fasttree建树失败，报错不是核苷酸序列？只能完成73%