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老师,您好,我在原版的XPCLR分析时得到最后的XPCLR_score,但是我想将窗口大小和步长与FST对应,图片所示,如何按照对应的窗口计算平均XP-CLR scores呢?
选择扫描
城南邹忌
2023-09-21 10:00
2
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1061
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请问,这个图代表什么呢,怎么有点奇怪
PSMC
红红火火
2023-08-30 21:16
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PSMC如何在一同一张图里用不同颜色展示不同分组的样品
PSMC
Iron
2023-08-23 10:08
1
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Admixture算STRUCTURE,出来的CV erro值随着K增大而递增是怎么回事,算了好几组数据都这样
薄信
2023-08-19 21:36
2
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我运行遗传群体进化的fst_pi_select_sweep.r这个脚本一直报错Error in dev.off() : cannot shut down device 1 (the null device),将dev.off()语句改为while (!is.null(dev.list())) dev.off()依旧报错,怎么解决?
李燕
2023-08-14 10:53
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您好,GWAS中的LD衰减分析,需要对用到的VCF文件进行过滤(缺失率,第二等位基因频率等)吗?
GWAS
徐鹏程
2023-07-10 10:42
1
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尊敬的老师,在按照咱们课程进行选择消除分析 fst pi ROD时,可以正常输出pi.wild,为什么画图的时候图为空的,是不是数据有问题,我的数据是真菌的,fai文件只有1kb,
☀️
2023-05-28 14:43
1
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老师,根据遗传进化课程做LD,测试文件和我的数据输出的文件都是空的,这是什么问题呢?
☀️
2023-05-26 18:40
1
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10
尊敬的老师!!恳请您在百忙中帮忙解答!根据群体遗传进化课程我构建进化树,显示如下错误。我的VCF文件通过如下命令进行排序,。排序后VCF文件缩小了很多,是对的吗?是不是我的vcf文件有问题,但是我PCA和STRUCTURE都是可以分析的,急需亲爱的老师们解答!!!
tassel
☀️
2023-05-26 16:34
0
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1547
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你好,我也遇到了相同的问题“PSMC分析有效群体大小(Ne),跑出来的psmc.fa文件是空的”,请问你的问题解决了吗? 我的测序深度是150X
Roy
2023-04-13 22:39
0
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你好,我也遇到了相同的问题“PSMC分析有效群体大小(Ne),跑出来的psmc.fa文件是空的”,请问你的问题解决了吗? 我的测序深度是150X
Roy
2023-04-13 22:39
0
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1368
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PSMC分析作图时物种的繁殖速度参数如何设置
诈胡
2023-04-07 20:25
2
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1780
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10
关于单倍型分析的问题
单倍型分析
Jia
2023-03-09 10:34
1
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2364
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使用plink做pca分析时报错
诈胡
2023-01-31 16:41
1
回答
2186
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10
请问用Mega7的muscle比对的时候报错该怎么办?
序列比对
Mer
2022-11-29 15:46
0
回答
1253
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自己LDdelay时,绘制不出图且ld.bin.gz和ld.stat.gz文件大小只有1kb,请问问题出在哪里?
Changing
2022-11-22 16:56
1
回答
1853
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Use of uninitialized value $l in numeric lt (<) at vcfutils.pl line 566.
PSMC
周国靓
2022-11-18 16:59
0
回答
1854
浏览
10
您好!在用XP-CLR时遇到问题 AttributeError: 'NoneType' object has no attribute 'keys' 该如何解决呢?
XPCLR
Rostem·Yalqun
2022-11-05 20:40
1
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做用于GWAS的全体的LD decay
LD decay
昵称无限无视
2022-11-01 11:07
1
回答
1436
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老师,请问在fst和pi联合选择分析的时候,使用群体遗传进化分析课程里的代码fst_pi_select_sweep.r时,显示command not found,怎么解决这个问题呢?
彭丽平
2022-10-21 15:55
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