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群体遗传进化分析课程中，如下图所示利用run_pipeline.pl -Xmx5G -importGuess $workdir/00.filter/clean.vcf.gz \ -ExportPlugin -saveAs supergene.phy -format Phylip_Inter这个代码并没有在01.phylo_tree文件夹中得到supergene.phy的文件

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请问老师做PCA分析时提示Segmentation fault是什么原因，该怎么解决呢

1 解决

docker安装失败 win11系统怎么装docker

  • 2022-02-08 01:07
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docker

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有关群体pop_Group.txt的问题，最大可以分几个组，如果分组太多怎么修改脚本的颜色设置

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LDdecay

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基于SNP绘制的进化树怎么添加外类群？

  • 2022-01-12 15:31
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5 Tajima's D 计算结果出图空白。

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5 #fst 与 pi 联合 筛选受选择区域

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#Fst 群体间多样性差异 vcftools Error: Unknown option:

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pi多样性绘图输入文件有数据，但绘图空白

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docker运行中出现segmentation fault，用的示例数据

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ref 换成水稻的，群体进化计算pi #pi多样性绘图输出为空白，不知道是不是没读入fai文件

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您好，可以把单子叶植物Ka/Ks突变速率参考文献发给我一下吗？我的邮箱：1316648272@qq.com。万分感谢！

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群体遗传进化分析 W文件中的PCA代码 出现bug

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老师您好，我利用Fst、π和Tajima's D方法对2个种群的重测序数据进行了选择清楚分析，获得了候选基因，我想请问一下筛选到的基因就是受到正选择的吗？需要怎样判断哪些基因受到正选择，哪些基因受到负选择？谢谢老师！

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进化

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10 构建物种发育树，使用busco获取单拷贝基因出错

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等位基因频率allele frequency 是什么,最小等位基因频率又是什么?

  • 2020-11-19 17:54
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请问构建进化树时出现三个分支是怎么回事呢