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老师请问这个比较基因组课程里串联法构建进化树，脚本里面的构树次数是不是不能小于50次啊，然后想问一下串联法和并联法一般来说哪个方法出结果比较快。

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GeMoMa报错

  • suj 2024-01-22 10:56
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使用circos对共线性结果进行美化，染色体的标签名字发生重叠，调整了参数也不起效，该如何调整？

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植物线粒体组装unicycler软件里的spades报错

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关于图形泛基因组中的Minigraph-Cactus的问题。

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3 在进行全基因评估后，出图不正确，同时在进行hifiasm三代组装的时候总是出现问题

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3 老师好，我用自己的数据根据参考基因组挂在染色体这一步，最后画共线性图报错，麻烦老师看一下

  • Song 2024-04-20 18:24
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求助：叶绿体基因组测序深度覆盖图的画法以及相关脚本。

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ALLHIC显示找不到sample.bwa_mem.bam

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5 从GC-depth看基因组是否存在污染

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10 想要使用plantcare做启动子分析，请问search for care里面输入的序列是什么序列啊？

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使用图中这条命令时参考序列格式是fasta.gz格式有影响吗，需要转化为fasta格式吗；此外我这个第一条命令jobs显示正在跑，后面的为什么不显示正在运行了啊，是有哪里错了吗？

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5 基因组去冗余的选择

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基因家族分析orthfinder运行过程中出现的问题

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braker报错

  • suj 2024-01-16 19:50
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5 在使用Gepard时出现了这样的图，与教程中的不一样，请问是哪里除了问题，如何改正？

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sqlite数据库 配置

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在进行二代测序数据的nt比对时出现了以下报错请问应该怎么解决

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请问ubuntu系统20.04版的，如何下载docker

  • 李 2023-12-28 11:02
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使用Bwa mem命令时，使用-M和不适用时候，对后续数据分析有影响？是否需要加-M？

  • 2024-02-03 18:58