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10 orthofinder运行出错

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3 老师，您好，GATK4.1 mutect2寻找体细胞突变没有正常样本panel，可以进行体细胞突变分析吗

  • 沉c 2023-02-19 15:56
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10 基因组课程结构注释：未提及Iso-seq全长转录组如何使用

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5 基因组共线性图不会分析

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10 基因组survey时K值的选择

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10 合并gvcf的问题

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10 如何安装和使用LTRharvest？

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10 请问一下怎么将几个物种叶绿体基因组进行多态性比对从而得到多态性位点？

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5 老师好！我分别用课程里fst, pi, TajimaD 方法筛选出的top5%基因，都是只有第一条染色体上的（我的数据一共有16条染色体），出的图也都只是第一条染色体的。但是用fst和pi联合筛选的基因，16条染色体上的都有。为什么会出现这种情况呢？

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5 老师，我安装mcscanx软件时打开所给网址显示有错误怎么下载啊？

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10 请问已知4dtv值，如何计算具体的分歧时间呢？

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10 在基因组组装中，有很多scaffold没有组装到基因组上，是因为什么？

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20 请问一下老师，物种间的进化树该怎么做？需要准备什么文件、工具？

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5 请问基因家族中串联重复基因的KAKS 数值在哪看？？有表示出来吗？？这一步的意义是什么

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10 请问有无预测蛋白质与蛋白质互作或蛋白质与DNA互作的网站？

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5 如何从CAFE结果中提取扩张（或收缩）的基因家族

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3 共线性分析做组间时，anchors文件只有以下内容，进行后续筛选和绘图时，报错为“need more values to unpack"，请问是何种状况？mcscanx分析有物种和同源性要求吗？

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5 基因id与cds id不一致，无法提取cds序列怎么办

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5 MCScan(jcvi) 生成anchors文件大小为怎么办？？？

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5 转录调控子（transcriptional regulator）和转录因子（transcriptional factor）什么区别？