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对于基因家族进化树构建前的一步，请问用MAFFT进行序列对齐、gblocks提取保守结构域、clustalw进行多重序列比对这三个动作的最佳先后顺序是什么？？

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请问mega7没有发现序列对的共同位点（83,19）该如何解决？没办法进行下一步的构建进化树了

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老师好，我的gene ID和mRNA ID 只有前面不一样，但是为了保证mRNA ID与pep和cds中的一样。删除mRNA：后就与gene ID 一致了。这影响后期的操作吗？

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请问裸子植物的全基因组在哪里可以下载

  • 2021-10-28 11:06
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5 老师，我安装mcscanx软件时打开所给网址显示有错误怎么下载啊？

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10 请问已知4dtv值，如何计算具体的分歧时间呢？

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kaks计算

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基因组测序品种选择问题

  • 2021-09-17 10:59
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老师你好，问一下如果所做物种只有基因组数据，没有转录本，CDS等文件，该用什么软件分析得到别的数据

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基因家族扩张收缩分析中，怎么样才算是显著扩张和显著收缩？

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在绘制共线性图是出现“zerodivisionerror: float division by zero”错误。我按照老师的讲解一共准备了五个物种的共线性资料，最后在绘图时报错。

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10 在基因组组装中，有很多scaffold没有组装到基因组上，是因为什么？

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老师好！我使用JCVI按照官网流程处理两个物种，每次都提示ValueError: A total of 0 anchor was found. Aborted.麻烦您帮我看看，谢谢！

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老师，在做基因结构时，脚本只能从GFF文件提出mRNA和CDS，做不出基因结构图，该如何解决，图中分别时GFF文件，脚本和提取的结果

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20 请问一下老师，物种间的进化树该怎么做？需要准备什么文件、工具？

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求助cafe预测基因家族总是在最后一步报错!

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老师，我在做基因序列结构分析的时候，有的序列只有外显子，这正常吗

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运行时报错

  • 2021-04-20 19:36
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老师，白菜的family.ctl这个文件如何获得，

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老师，我在做共线行分析时，出现这种情况，该如何解决