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5 老师，您好，学习咱们得基因家族分析课程。按照咱们得代码运行，发现第二次搜索hmmsearch，发现输出空吧，我把以前生成的文件和你们提供的demo比了一下都一样，可是WRKY_domain_new_out.txt空白

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进化关系分析老师你好！我想看看这几个bhlh基因中的哪个和sa6G516730的亲缘？ 进化分析得出sa6G516730跟bhlh12 关系比较近，但相似度分析sa6G516730跟bhlh114比较近这种情况下我该选择112还是114呢？

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10 NCBI序列上传

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老师你好！多个物种（黄瓜、拟南芥）构建进化树，用蛋白序列做多序列比对时，把所有序列一起弄到MEGA软件中进行比对这样做对么？有老师说用mega做多序列比对时，序列数最好不要超过80条，我提交了300多条一起做的多序列比对，这样做出来的结果会不会有问题呢？

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请问怎么找不同棉花品种里面的直系同源基因？

  • 2020-05-06 23:24
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各位老师好，我要分析的基因家族没有fa. pep. gff3. 和cds文件，请问还有其他办法进行分析吗？

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请问老师植物叶绿体基因组数据GFF和CDS等怎么下载？

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提交基于二代测序的数据组装分析得到的基因组组装数据

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老师你好！有关MCscan的使用

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5 bootstrap consensus tree导出nwk文件格式时Branch_lengths选项无法选择

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老师，下边这种物种之间的进化是一个基因和他的同源基因做出来的嘛，如果是基因家族的所有基因可以做这种物种进化嘛

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您好，Mcscan分析出来线条太少，是什么原因造成的？

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20 NCBI的数据库更新了，两份数据文件用哪个？

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MCScan共线性分析画图问题：list index out of range

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10 请问大神们同一“目”（Order，分类学定义）下物种的基因组相似性大不大，想做比较基因组。

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5 假基因预测问题

  • 2020-04-08 20:35
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我想学习一下python版MCScanX绘制分析基因共线性，请问我要买哪个课程？

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老师，请问有分析共线性的方法麽

2 解决

5 请问是不是只有正链的顺式作用元件才调控基因表达

1 解决

请问老师这种图用什么软件做的？将不同染色体上的同源基因用相同颜色表示