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16S分析批量拼接时报错如何解决

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请问扩增子分析的时候保留多少条OTU/ASV比较合适？

  • 大k 2021-02-28 23:05
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您好，我跟着咱们的一篇文章进行操作，在第四步始终找不到文件，应该怎么操作呀，是关于faprotax这个程序，无法继续进行下去，请老师指点

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跟着文章用docker运行代码进入虚拟机提示：我在将Windows文件提交到wls中，而且一直找不到omicsclass/ampliseq-q1：latest locally

  • 2021-02-05 20:50
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10 老师 ，您好，我想请问一下qiime2双端拆分barcode的事情，如果您回复，将感激不尽

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老师您好，我根据课程步骤的指令，改不了文件的格式，我能找到format_fa_for_qiime.pl文件，还把它放到了操作的文件夹，但是电脑找不到这个文件，是什么原因呢

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多样性数据实操 OTU注释报错

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5 您好，我使用rescript结合您发表的qiime2分类器建立sliva数据库一文，发现自己做到最后一步，数据库训练时一直显示内存不够，除了增加内存，还有没有其他的办法解决这个问题？例如，设置那些参数之类的？或者，我还要多大的内存才能做呢？谢谢

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cytoscape插件conet运行报错

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微生物多样性分析的程序复制shell中不能运行

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16S多样性分析docker镜像发布及使用中，合并fasta文件，并加序列号部分的命令中，rename_fa_id.pl显示没有此命令，请问老师是怎么回事？

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小白来提问：哪位大佬能给我说一下OTU分类吗?看定义不是很懂，才接触这方面知识。

  • 2020-10-15 16:39
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视频里面说的 amplicon.demo.tar.gz 和 data base . ta ,这两个压缩包，不知道怎么下载，可以提供一下吗?第一次用这个提问，可能重复提问了，抱歉。

  • 嘉 2020-09-15 16:38
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UPARSE to pick OTUs in QIIME

  • 2020-08-26 13:35
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5 老师您好，我在做宏基因组学分析时，由于样本数据量过大，将所有样本质控后的reads用进行组装时，会出现服务器内存不足无法组装的情况。那我想将每个样本的数据分别组装，然后将样本contig文件进行合并后再进行下游分析。这种方法可行吗？

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想请教一下，conet网络构建的课程，用提供的数据文件分析完全可以，但是用我的数据文件就报错。我尝试了用测序公司提供的xlsx格式，并把数据形式改成和课程提供数据完全一样，再转化成txt制表符文件格式后输入，选择第二个选项（由biom格式转化来的文件），结果报错。把测序公司提供的biom格式文件输入，选择第三个选项（biom HDF5格式，还是报错）。这是什么问题呢？

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老师您好，请问在利用conet作分析的过程中置换检验大概需要等待多久完成，电脑一直处于计算状态。。。

  • 2020-05-14 19:42
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CoNet构建OTUs网络图，一直报错！

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老师，请问我在cytoscape中使用conet插件绘制互作网络图，我上传了两个文件，第一个文件是图一，第二个文件是图二，我不想用OTU的ID号做分析相，想做门水平的细菌，第二个表是抗性基因的数据，想观察抗性基因和门水平菌的共现性网络。但是总是显示报错，请问您知道大概有什么原因吗？

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疾病与正常对照的微生物群落CoNet分析

  • Lynn 2020-03-07 21:00