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关于q2-cutadapt demux 的问题
qiime2
柯儿呀
2021-05-30 22:18
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老师您好,请求帮助!MENA分子生态网络分析时,上传200个OTU节点,但是最后显示nodes为383 (其中一部分不包括上传的节点),请问这样的结果合理吗?为什么会出现这样的情况呢
MENA
Angelia小婷
2021-05-17 15:18
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老师,您好,我用cytoscape conet绘制微生物网络图,用原始biom文件还是txt文件均报错,报错内容为java.lang.NumberFormatException: You did not specify the row and column number of the matrix correctly! 请问是什么原因,
Delicious忌语
2021-04-27 14:40
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老师,您好,恳请帮助,请问VPA方差分解分析中交叉部分为负值,并且可解释部分+不可解释部分不为1,这个怎么解释呢
VPA方差分解分析
Angelia小婷
2021-04-16 16:18
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你好,我是初次接触网络分析绘图,在R中运行以下代码总是报错
co-occurrence
檸檬树夏柠檬果
2021-03-19 21:23
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老师,您好,我想请问一下,conet分析时,如果不加环境因子的时候可以正常运行,但是加上环境因子就不行,想问一下是什么原因?下面是我环境因子的格式,我用notepad++转换成文本格式了
conet
胡小帅
2021-03-13 18:24
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16S分析批量拼接时报错如何解决
乖丶一边傻去
2021-03-03 09:28
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请问扩增子分析的时候保留多少条OTU/ASV比较合适?
扩增子
OTU
大k
2021-02-28 23:05
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您好,我跟着咱们的一篇文章进行操作,在第四步始终找不到文件,应该怎么操作呀,是关于faprotax这个程序,无法继续进行下去,请老师指点
FAPROTAX
刘彤彤
2021-02-05 20:53
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跟着文章用docker运行代码进入虚拟机提示:我在将Windows文件提交到wls中,而且一直找不到omicsclass/ampliseq-q1:latest locally
2021-02-05 20:50
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老师 ,您好,我想请问一下qiime2双端拆分barcode的事情,如果您回复,将感激不尽
qiime2
Barcode
Ading耶
2021-01-17 12:34
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老师您好,我根据课程步骤的指令,改不了文件的格式,我能找到format_fa_for_qiime.pl文件,还把它放到了操作的文件夹,但是电脑找不到这个文件,是什么原因呢
16S
小野猫
2020-12-24 11:32
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3047
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多样性数据实操 OTU注释报错
qiime
16S
清风徐来
2020-12-20 10:32
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您好,我使用rescript结合您发表的qiime2分类器建立sliva数据库一文,发现自己做到最后一步,数据库训练时一直显示内存不够,除了增加内存,还有没有其他的办法解决这个问题?例如,设置那些参数之类的?或者,我还要多大的内存才能做呢?谢谢
qiime2
秦明森
2020-12-17 22:08
1
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4060
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cytoscape插件conet运行报错
Cytoscape
conet
鑫双
2020-11-22 18:58
1
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微生物多样性分析的程序复制shell中不能运行
gump23
2020-11-03 14:24
2
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16S多样性分析docker镜像发布及使用中,合并fasta文件,并加序列号部分的命令中,rename_fa_id.pl显示没有此命令,请问老师是怎么回事?
rename
16S多样性
肥尔普嵩
2020-10-17 22:40
1
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小白来提问:哪位大佬能给我说一下OTU分类吗?看定义不是很懂,才接触这方面知识。
OTU
2020-10-15 16:39
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视频里面说的 amplicon.demo.tar.gz 和 data base . ta ,这两个压缩包,不知道怎么下载,可以提供一下吗?第一次用这个提问,可能重复提问了,抱歉。
16S
嘉
2020-09-15 16:38
1
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3490
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UPARSE to pick OTUs in QIIME
qiime
2020-08-26 13:35
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