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5 老师您好，我在做宏基因组学分析时，由于样本数据量过大，将所有样本质控后的reads用进行组装时，会出现服务器内存不足无法组装的情况。那我想将每个样本的数据分别组装，然后将样本contig文件进行合并后再进行下游分析。这种方法可行吗？

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想请教一下，conet网络构建的课程，用提供的数据文件分析完全可以，但是用我的数据文件就报错。我尝试了用测序公司提供的xlsx格式，并把数据形式改成和课程提供数据完全一样，再转化成txt制表符文件格式后输入，选择第二个选项（由biom格式转化来的文件），结果报错。把测序公司提供的biom格式文件输入，选择第三个选项（biom HDF5格式，还是报错）。这是什么问题呢？

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老师您好，请问在利用conet作分析的过程中置换检验大概需要等待多久完成，电脑一直处于计算状态。。。

  • 2020-05-14 19:42
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CoNet构建OTUs网络图，一直报错！

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老师，请问我在cytoscape中使用conet插件绘制互作网络图，我上传了两个文件，第一个文件是图一，第二个文件是图二，我不想用OTU的ID号做分析相，想做门水平的细菌，第二个表是抗性基因的数据，想观察抗性基因和门水平菌的共现性网络。但是总是显示报错，请问您知道大概有什么原因吗？

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疾病与正常对照的微生物群落CoNet分析

  • Lynn 2020-03-07 21:00
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5 疾病与正常对照的微生物群落CoNet分析

  • Lynn 2020-03-07 20:37
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Cytoscape的CoNet插件相关性阈值的设定

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10 如何批量根据微生物种属名称下载某一功能蛋白的氨基酸或核酸序列？

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结构方程模型中细菌或真菌群落组成表示

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你好老师有关网络图绘制的问题

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关于绘制OTU与环境因子互作的网络图

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宏病毒组得到的contig如何做系统发育分析，包括如何选取合适的序列？contig是否需要截取相应的基因片段？如何截取？

  • 2019-10-22 13:47
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老师，您好，在学习样品与OTU二分网络图的绘制中，导入Cytoscape中的文件ewight值是如何计算的？

  • 2019-10-07 13:29
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老师您好！请问一个处理只有5重复，能用这5个重复在MENA中做16S网络图分析吗（相当于MENA分析的样本量为5）？MENA网络图分析对样本量的要求是多少呢？

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5 你好 我现在在用cytoscape的conet做共现网络分析图，去掉世系之后确实是可以运行正常的，但是我做的图是需要世系的，因为需要标出图例，表明是在门分类下 具体是哪种微生物，请问我要怎么去调整taxonomy的数据格式才能使得conet不报错

  • 2019-07-31 11:12
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5 老师，您好，我在MENA上传示例数据时候，总是出现错误，这是网站的原因吗？

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5 大家好，我第一次注册分子生态网络MENA账号是总是提示邮箱和账号已被用，试了好几次都不行，请求各位大神指点迷津

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用qiime识别16S测序结果的嵌合体（chimera）要多久？为什么等好久没反应，输入命令都变成乱码？

1 解决

5 请问用cytoscape进行conet网络构建时原始数据文件是怎么得来的