2 回答

CombineGVCFs报错：htsjdk.samtools.SAMFormatException: Did not inflate expected amount

2 回答

3 用samtools call出单个样本的rawvcf文件，合并之后发现samtools不像GATK的文件gvcf那样保存与参考基因组相同的位点，而是在合并之后都变成了缺失，想咨询一下samtools call出的这组数据还可以用吗，有什么办法？

0 回答

5 大佬们，构图软件lepmap、joinmap分群的时候怎么让分群数与染色体数一致？调LOD值也很难保持一致，求大佬们解答！！！

1 回答

使用GATK的GenomicsDBImport合并gvcf导入db时报错Unexpected compressed block length: 1 for /work/GATK/BN14.g.vcf.gz

2 回答

5 请问在用SURVIVOR进行多样本SV合并出错

  • 2024-04-14 13:38
0 回答

5 gwas分析tassel软件GUI界面PCA文件，表型，和hapmap文件合不起来

1 回答

请问老师，使用annovar进行注释出现报错，如下：Error: invalid record found in exonic_variant_function file (exonic format error)

1 回答

合并g,vcf

  • Jay 2024-03-11 19:42
1 回答

50 单倍型报错

1 回答

Fst染色体数量不对

  • 231 2024-01-16 22:21
1 回答

变异结果过滤，gatk VariantFiltration

1 回答

annovar注释疑惑

1 回答

请问在引物设计时出现了这样的问题怎么解决啊？

  • kid 2024-01-03 15:54
1 回答

基因组重测序使用qualimap 出现Exception in thread "main" java.awt.AWTError: Can't connect to X11 window server using 'localhost:18.0' as the value of the DISPLAY variable.

1 回答

注释完绘图出现报错信息

2 回答

VCF注释

  • Jay 2024-05-16 11:41
1 回答

合并g.vcf

  • Jay 2024-03-12 19:22
1 回答

变异结果质控过滤，去掉低质量变异结果时报错i

1 回答

如何从重测序的原始数据中提取某个基因序列？

1 回答

vcftools --vcf GT_AGCT_Liujingyan.vcf --max-missing 0.5 --maf 0.05 --remove-indels -- min-alleles 2 --max-alleles 2 --minDP 2 --minQ 20 --recode -- stdout >SNP_filter_maf0.05_miss0.5.vcf在这基础上增加杂合率，激昂杂合率设为80%或者60%，如果是自交系或纯合体，杂合率设为10%-20%怎么改