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请问在引物设计时出现了这样的问题怎么解决啊？

  • kid 2024-01-03 15:54
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重测序分析，bam去重复，建立索引后，call SNP之前的步骤

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变异结果过滤，gatk VariantFiltration

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请问老师，使用annovar进行注释出现报错，如下：Error: invalid record found in exonic_variant_function file (exonic format error)

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3 进行bam文件排序时报错 killed

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使用GATK的GenomicsDBImport合并gvcf导入db时报错Unexpected compressed block length: 1 for /work/GATK/BN14.g.vcf.gz

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注释完绘图出现报错信息

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参考基因组建立索引为什么生成的unknown—refGeneMrna.fa 和 unknown—refgene.txt 都是0K？

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群体结构中的最佳K值

  • 231 2023-10-13 09:52
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vcftools --vcf GT_AGCT_Liujingyan.vcf --max-missing 0.5 --maf 0.05 --remove-indels -- min-alleles 2 --max-alleles 2 --minDP 2 --minQ 20 --recode -- stdout >SNP_filter_maf0.05_miss0.5.vcf在这基础上增加杂合率，激昂杂合率设为80%或者60%，如果是自交系或纯合体，杂合率设为10%-20%怎么改

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50 单倍型报错

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老师您好，请问一下GWAS筛选植物NPK高效因子前需要做什么准备工作

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参数设置

  • Jay 2024-01-15 13:41
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annovar注释疑惑

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重测序annovar注释

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在NCBI网站上，同一个SAMN具有多个SRR文件，获得的fastq文件合并成一个文件

  • bomm 2023-12-14 22:46
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GATK过滤掉三分之一的位点正常吗

  • 231 2023-12-14 12:49
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质控 Per base sequence content

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请问老师R脚本运行后没有图片输出怎么处理？

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gvcf合并成vcf文件