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老师好!我在运用课程代码进行Treemix分析后,会生成:cov.gz,modelcov.gz,treeout.gz等相关文件,现在我想知道:在混合事件的情况下,覆盖方差的比例和估计的混合比例,这个应该怎么进行计算统计呀?我不清楚这个解释比例是怎么计算的?谢谢老师!
Treemix基因流分析
2022-12-10 16:31
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老师好!我在运用课程代码进行Treemix分析后,会生成:cov.gz,modelcov.gz,treeout.gz等相关文件,现在我想知道:在混合事件的情况下,覆盖方差的比例和估计的混合比例,这个应该怎么进行计算统计呀?谢谢大家!
2022-12-10 10:29
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老师,您好,我想请问一下,就是XPCLR计算的时候(老版的),我看你的博文写的(https://www.omicsclass.com/article/1334)遗传距离(可简单的物理距离/100000000),就是我写论文计算也可以直接用这样简单表示遗传距 吗,还是需要将snp根据遗传图谱呀?
XPCLR
早睡早起
2022-11-27 19:43
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用tassel软件输入的表型数据是质量性状时输入格式是和数量性状一样吗?用0和1进行赋值
Luck
2022-11-23 10:52
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您好,用tassel做gwas的时候质量性状的输入格式和质量形状的输入格式是否一样呢?
Luck
2022-11-17 16:32
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如何下载国际千人基因组计划完整vcf文件
1000G
VCF
特调特派员
2022-11-12 17:36
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kasp精细定位
管笑啸
2022-09-18 14:09
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BSA结果,只有一个SNP
管笑啸
2022-09-18 13:36
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老师如何利用gatk只对某几条染色体进行变异检测? 另外,如何使用gatk 设置线程数量?谢谢老师
行健
2022-09-15 17:03
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HGMD数据库
HanKui
2022-01-22 00:10
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诱变材料,且已自交 6 代,是否可用 QTL-seq 的方法来定位到基因?
《心向阳光&
2021-12-27 12:05
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做关联分析时能否将颜色的RGB数值组转化成0到1或者-1到1的单个数值?求教!可付费!
短歌行向阳花
2021-12-21 08:42
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同一目下边的俩物种,基因组测序数据mapping率只有20%,这合理吗?
安静,安好
2021-12-10 15:08
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根据课程基因组重测序的脚本,进行片段inner size,片段选择是否异常和测序深度与覆盖度统计均未能生成pdf文件,直接弹出如下对话框和如下命令
2021-09-12 14:16
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50
老师就BSA分析中MutMap 分析:95% 99%阈值置信区间是如何计算的这个我还有点疑惑
BSA
刘孝伟
2021-07-20 14:21
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老师就 BSA分析中MutMap 分析:95% 99%阈值置信区间是如何计算的这个我还有点疑惑,https://www.omicsclass.com/article/1305就是这个网站里面的解答
BSA
刘孝伟
2021-07-20 13:52
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提取vcf文件中的信息
vcf文件
Iron
2021-05-19 00:44
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黄老师,怎么利用BSA测序的数据的双亲和子代池的重测序数据设计KASP标记,有没有这方面的脚本可供学习
BSA
KASP
SNP
杨辉
2020-07-13 22:23
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