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老师我已经用gemma找到了显著位点，现在想将两位点之间连锁不平衡程度r方大于0.35，且标记之间距离在300KB以内整合成一个qtl，应该用什么命令啊？

  • WHR 2024-08-15 12:30
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为什么docker中cocker search 搜不到omicsclass了

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扩增子分析结果的差异显著性的p值在哪里找到

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老师，HGMD链接失效了，可以再分享一下HGMD数据库的信息吗？

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老师 就是Rhododendron_delavayi 和Rhododendron_irroratum这两种植物，我把它的fasta和gff3文件下载，然后做各物种的cds和pep文件提取，文件都能出来，但是就是出来的文件是空的，这个问题要怎么处理啊，麻烦老师帮我看一下，谢谢

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老师 请问以下就是circos图中，染色体怎么设置才能使按照1到13这种顺序排列，还有就是圈图中，染色体间的共线性线条怎么才能换成几种颜色，并不是单一的颜色。图1那种结果，而不是图2的那种结果。

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老师 就是Rhododendron_delavayi 和Rhododendron_irroratum这两种植物，我把它的fasta和gff3文件下载，然后做各物种的cds和pep文件提取，文件都能出来，但是就是出来的文件是空的，这个问题要怎么处理啊，麻烦老师帮我看一下，谢谢

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基因组注释Braker里面的报错

  • 2024-08-12 21:27
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老师，您能给找找这几种杜鹃的genome.fasta和gff3文件吗，我找到的文件在提取cds和pep的时候，一直是错误的。

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R语言下载GSE数据一直在报错

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老师 就是在计较基因组学哪里 请问一下下面这些物种的这些物种怎么下载它的genome.fasta和gff3啊 我在ensemble plant和jgi上都没找到，而且在ncbi上找到下载啦 打不开，，这种要怎么解决啊，

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老师 我想问一下 怎么把做出来的圈图上面的染色体按照chr1-13 这种顺序排列啊 不是下面第一种排法，而是第二种排法 按照顺序排列的

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15 老师好，我在利用在SNP设计dcasp标记时得到的primers.result.xls文件为空。

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过滤后的vcf文件怎么把标记划分为八种分离类型（ab × cd、ef × eg、hk × hk、lm × ll、nn × np、aa × bb、ab × cc 和 cc × ab）？

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3 GWAS计算表型数据blup时一直出错

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docker创建共享文件夹失败，docker run rm it -v D:\gwas anlysisl:work omicsclass/pop-evol-gwas:v1.2命令后出现invalid reference format怎么解决

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5 为什么下载后运用显示找不到images呢

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手动筛选100kb以内的串联重复，两条染色体的起始位置有点重复

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如何TajimaD筛选选择区域内的受选择基因的问题

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老师您好，为什么在gwas最后的筛选关联区域SNP信息时，总报错错误信息如下，总是被杀掉，vcf文件应该是没有错的，截图如下，输入文件如下，请您帮忙查看，我该怎么修改我的命令

  • WHR 2024-08-04 18:46