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5 老师能不能写一下用咱的虚拟机使用orthofinder

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想问一下老师这个是怎么回事？

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老师您好，在GEPIA中，可以进行TCGA和GTEX的对比分析，因为我研究的瘤种中TCGA基本没有正常对照，我想问一下，怎么能将TCGA和GTEX联合分析，需要用什么表达值，如何处理批次效应？

1 解决

18 在R中进行差异表达分析，运行GDCdownload(query = query, directory = DataDirectory,files.per.chunk=6, method='client')代码时，数据下载失败，并显示如下错误

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GDCdownload(query = query, directory = DataDirectory,files.per.chunk=6, method='client')下载TCGA数据时出现In if (grepl("^https?://", url)) { : 条件的长度大于一，因此只能用其第一元素 错误，数据下载不下来

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安装docker toolbox 报错：Looks like something went wrong in step ´Looking for vboxmanage.exe´… Press any key to continue…

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请问这两个基因ID不同是有什么区别吗？在后面做筛选的时候，就只能出来基因ID短的，这些基因ID长的筛不出来的原因是什么呢？希望可以回复下

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Graphpad Prism 能制作气泡图吗？怎么操作那？

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老师，你好，我想问一下有没有一种购买方式，可以将组学大讲堂的所有课程可以观看一年的这种购买模式

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老师你好！有关MCscan的使用

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老师，麻烦问一下制作基因结构图时，gene_exon_info.gff文件始终为空的，

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5 bootstrap consensus tree导出nwk文件格式时Branch_lengths选项无法选择

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我想用cytoscape做相关性网络图，怎么按照微生物的分类水平区分颜色

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老师您好，xena里下载的经过log（counts+1）的值可以直接用DESeq2包进行差异分析吗，还是需要再转换回去？

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请教TCGA差异表达分析分组问题

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5 segentation fault

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请问图中是数据库中表达数据做的表，WT_C,WT-ABA。。。分别代表什么

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想请问一下老师，出现这个怎么解决？

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老师，下边这种物种之间的进化是一个基因和他的同源基因做出来的嘛，如果是基因家族的所有基因可以做这种物种进化嘛

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老师您好，为什么我在安装虚拟机后，用ll命令打开直接就有share文件夹，但是Windows-share与share不能建立共享呢

  • 2020-04-20 17:07