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NCBI中下载SRA数据不成功

  • zhoy 2020-03-09 00:12
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求问大佬，scaffold水平的circos图会影响生物学意义吗？

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老师我在做KAKS分析时，生成的.axt文件对比序列不是三的倍数，我按操作手册的方法，提高的筛选条件，

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有参转录组自主分析学习过程中遇见的问题

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5 求助大佬，MCScanX输出结果空白

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请问mcscanX比对时，这种情况是运行结束了么？

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疾病与正常对照的微生物群落CoNet分析

  • Lynn 2020-03-07 21:00
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5 疾病与正常对照的微生物群落CoNet分析

  • Lynn 2020-03-07 20:37
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老师您好，我想请问一下如果我想做植物在干旱胁迫下不同时间点的应答的WGCNA分析，这种试验有性状数据文件吗？

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老师，我在做Mapchart绘制基因染色体位置图时遇到下面的问题

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20 【NCBI传数据aspera】老师请教一下，在Mac的终端里，这段命令没有反应，也想不到解决办法了。

  • 2020-03-07 17:41
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5 求助大佬，通过id提取domain序列的时候，e_value设置1e-20一个都没有怎么办？

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老师，我的counts值的mRNA表达数据，用limma包之前，需要将表达矩征标准化嘛？

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5 老师您好，在用mcscan分析之前发现，gff文件里没有gene，只有cds和exon怎么处理？

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5 各位老师好，我在做拟南芥紫色酸性磷酸酶基因家族分析，该家族中有29个相关基因，我通过pfam 数据库关键词搜索得到一个检索号，然后下载后通过hmmsearch 分析，但结果只有25个相关基因，请问是怎么回事？问题出在哪里？

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你好，请问小麦基因组中的Un是不是不能用于串联重复和片段重复分析?谢谢

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请问老师，GFF文件里，好多个蛋白对应的基因高都相同（重复）是怎么回事？如图为筛选后蛋白对应的基因号，起始终止位置倒是不同。这是什么生物学现象吗还是错误

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mcscanX相关问题

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5 clustalw我输入1,回车,结果1被删除,程序不运行,试了无数次都是这样,哪位知道这是为什么呀?谢谢了!检查序列没有重复

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求助大佬笔记本购买相关# 现在用一台五年前笔记本，i5，12G（4+8应该不能组成双通道吧），gtx960显卡，无固态。不是纯生信专业，也就做做基因家族分析和转录组分析，如果不想上台式的话，买什么配置的笔记本体感提升会非常大呢？另外如果买macbook的话普通生物软件全不全？毕竟还要做湿实验