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WGCNA 表达量低的基因筛选

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基因家族提取用hmmsearch --domtblout result.txt --cut_tc zf-C2H2.hmm Fvesca_226_v1.1.protein.fa 时提示 Failed to open tabular per-dom output file result.txt for writing

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用 domain_xulie.pl 提取 domain.fa 时文件为空，请老师指点一下

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基因家族hmmsearch时提示Failed to open tabular per-dom output file result.txt for writing

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转录组数据上传GEO

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基因家族文章一般发哪些期刊较容易？

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共线性分析画图出错

  • 2019-04-13 18:04
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获取保守结构域序列

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5 安装Rstudio上的glmnet包时总是出现图片上的情况，怎么么办呢，求指点

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5 mapman导入自己的转录组数据，从网站上下载了数据分析时用的参考物种的mapping数据，但使用时显示data does not fit mapping used(no data points mapped)! 请问该怎么解决？谢谢

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老师，我在绘制基因在染色体上位置的图片时，5号和10号染色体飞出画布，请问是怎么回事

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5 blast比对寻找基因家族

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已有一段序列及相应的氨基酸如何blast基因组中的基因家族

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物种间共线性分析染色体不显示字母

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5 老师好，我按照您的代码用itol做的外层圆环只有一种颜色，想呈现不同的颜色，百思不得其解，恳请老师指点！

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5 你好，我目前正在用WGCNA但不知表达矩阵怎么构建？

  • 2019-04-11 19:52
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5 老师，我利用脚本得到对应基因的蛋白序列： perl script/get_fa_by_id.pl WRKY_removed_redundant_IDlist.txt Arabidopsis_thaliana.TAIR10.pe p.all.fa WRKY_pep_need_to_confirm.fa 时，程序出现错误。 ，这是怎么回事啊？

  • DII 2019-04-11 19:38
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多序列比对问题

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合并提取后的domain序列之后，linux系统中的clustalw不能读出蛋白信息

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小菜鸟，请问各位大咖基因序列比较短时做定量分析用什么方法比较好