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老师,用admixture做群体结构时,可以绘制单独一个k值的结构图吗?另外用代码跑出来的图怎么修改横纵坐标的字体以及大小呢?
STRUCTURE
admixture
山外小楼
2024-06-24 11:32
1
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530
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上传CNCB测序数据出现问题,请问大佬们需要怎样处理啊?
鱼丸&粗面
2024-06-24 11:07
1
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763
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老师,我这个是桑树的fasta和gff文件,不是从官网下载的。假如各个网站都找不到我想要的物种的基因组文件,只有手头这个文件,我要怎么做才能和教程的代码连接上呀?或者说碰到这种目标物种查不到的情况可以怎么做呢?
genome
GFF
蚩尤
2024-06-23 22:27
2
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老师好,我在做群里遗传进化算pca时,得到的文件都是0。但是没有报错
PCA
马杰宇
2024-06-23 21:39
0
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使用fq文件去重脚本出现问题
鱼丸&粗面
2024-06-22 23:50
2
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老师您好,我按照课程提供的流程泡自己的数据,在fst pi tajimaD分析的过程中,发现生成的曼哈顿图没有数据,在第一步的过程中,我们确实成功的生成了染色体对应的起始位置和pi值,但在pi多样性绘图输出时却发现没有数据,这是怎么回事呢,请老师帮忙解决
曼哈顿图
per
2024-06-21 16:37
0
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下载docker是出现这个问题
李
2024-06-21 15:52
1
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老师 您看一下 这个是hic的测序方法
Hic挂载
烟雨易冷
2024-06-21 15:21
2
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706
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老师,绘制PAV图时,结果如图,还有报错信息
泛基因家族
PAV
Orange_flame
2024-06-20 17:54
2
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766
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老师,下面是报错、染色体信息、gff文件中的染色体和命令行
GFF
Orange_flame
2024-06-20 15:18
2
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753
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泛基因家族分析,提取CDS序列结果如图所示,并且文件大小只有38KB,是不是这个基因组就不能用了
GFF
GFF3
Orange_flame
2024-06-20 11:39
0
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566
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估算物种分化时间
花宝叽
2024-06-19 19:41
1
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基因家族新版解压总是报错,无法获取更新后的脚本
海涛
2024-06-19 12:29
1
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690
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对于同一种系来源的生物体的基因组(比如都是人类的基因组),我要进行连锁不平衡分析,不同批次的数据对连锁位点的判断相同吗?
连锁
赵一琦
2024-06-19 10:23
0
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5
stairway-plot里的mu(每代每位点的突变率)参数怎么确定?mu: assumed mutation rate per site per generation.
有效群体大小
李念
2024-06-18 22:58
0
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5
stairway-plot里的L参数怎么确定?
群体有效大小
李念
2024-06-18 22:55
0
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858
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16S Picrust2
16S多样性
picrust2
lou文博
2024-06-18 21:34
2
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764
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老师 您说bwa比对哪里 能正常生成,就是在allhic对congtig分group那一步一直出错,我把bwa比对生成文件截图放后面了 老师您看一下
allHic
烟雨易冷
2024-06-18 15:36
1
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在用gemma分析gwas时,调用perl脚本中的sort_trait.pl,发生报错,请老师帮忙解答,谢谢老师。
GEMMA
东篱
2024-06-17 11:13
1
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WGCNA样本必须至少15个吗?
zhuzhuxia
2024-06-16 22:29
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