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5 blast分析重复基因对

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5 如何在测序结果里搜索自己想要的结果或者说文件？

  • 2019-03-22 16:40
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fastq文件前面的预处理

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请问怎么用RNAseq获得的counts数据，再计算相应的FPRM值呢？求较详细方法或建议。谢谢了

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老师我想问一下我没有以下这种情况，就是比如说鉴定的马铃薯基因在马铃薯数据库中有，但是在ncbi中没有找到它的序列，这种情况应该怎么做呢，因为要做基因定量的话只有在ncbi中可以看到它的CDS区

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请问做基因表达热图，应该用转录组数据的counts值还是FPKM值呢？

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请教一下，如果基因组注释文件不是染色体序号而是scaffold序号，是不是代表着这个物种的基因组染色体定位尚不明确呀？

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请教一下，可否用一个物种基因家族的保守结构域序列和另一个物种相同基因家族的全部序列用NJ法建树？

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请问老师，做基因组共线性的物种组装必须都是complete genome吗？还是 scaffold也可以呢? scaffold水平有什么弊端？

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我只关注黄酮代谢相关的基因，能否只提取这部分基因来做差异分析？

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某基因在两个样本中表达量差别很大，分析结果却是非显著差异基因，这是为什么？

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老师 我在做blast比对时 由于速度太慢 我使用了diamond命令 但发现生成的表格比对序列的太多 我想提取比对最好的前5个 请问怎么用perl提取呢

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糖苷水解酶家族1 在茶树染色体的定位图

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5 MCScanX分析中collinearity文件没有结果 其余都有 是什么原因呢

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5 蛋白序列ID和cds序列ID不一致

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老师，我用perl script/domain_xulie.pl去除冗余，最后生成文件没有分行，显示在一行，看不到对应关系

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老师您好，我想问一下关于双通道芯片转录组数据分析的相关课程和资料有吗？因为我在GEO数据库里找到的我需要的转录组数据是双通道芯片的

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circos图如何将指定基因名称标记出来？

  • 2019-03-19 21:29
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如何通过GEO数据库中的数据得到某个基因表达量？

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cdt和gdr文件如何查看？