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提取VCF 文件里的SNP

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请问在做SSR分析用circos,会显示配置文件报错要怎么解决呢，完全粘贴课程内容中的conf配置文件

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老师您好，我在参考基因组比对的时候，出现报错，请老师解答

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你好，我也遇到了一样的问题：docker里omicsclass的镜像都搜索不到了，然后下载omicsclass/gene-family:v1.0.1也报错，联系客服也没有回应，可以请教一下你是怎么解决的吗

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想请教一下 cds.TEM 数据 ，然后也得到了cds里的名和KO0001表对应好的eggNOG里的表。想变成 KO0001-样本 的丰度数据表，应该怎么操作，合并KO0001的丰度？

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老师您好，我在参考基因组比对的时候出现报错

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老师您好，在参考基因组比对时出错。

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老师您好，我的重测序数据在NCBI上按照（双端下载是这样：https://www.omicsclass.com/article/1703）这个教程下载的，但是在做数据质控的时候总是报错，以下是数据，您看看哪儿存在问题。

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重测序分析

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绘制核心基因和可变基因饱和曲线时提示错，检查文件没有问题。

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数据质控出现报错

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老师，构建泛基因列表使用的vcf文件，是下面图中的sv数据吗，下面表格包括了CHROM，POS，REF，ALT，TYPE，MAF,MIS，ANN，将这些数据整理成vcf吗？

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请问这个是中间文件吗，注释成功后，就可以删除掉，节约空间，是吗？

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组装后的cds.fa文件进行Kegg注释

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老师，我在做泛基因列表时，提取最长转录本都成功提取，但其中一个基因组一直无法提取cds，后来查看提取出的转录本格式一样，但有些内容可能与其他基因组不一样（下载数据时，这个基因组格式是gff3，其他为gff，提取最长转录本时我把他改为了gff），您那边是否可以帮忙修改这个基因组的gff文件，

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您好老师，我想咨询一下plink 软件core dumped报错

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您好老师，我想咨询一下plink 软件core dumped报错

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老师，请问分析fasta格式的文件需要全部转成gff格式再分析吗？

  • 2025-02-26 23:00
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如何下载别人的重测序数据

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3 docker 安装