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iqtree 分析需要ASC矫正嘛？

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gatk callSNP 和bcftools call snp 哪个会更好一些，bcftools得到的 all raw vcf.gz ,也是使用4.snp_indel的过滤1/2/3 步骤进行过滤嘛？ 过滤1：gatk VariantFiltration过滤2：vcfutils.pl过滤3：vcftools。

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run_pipeline.pl -Xmx30G -importGuess all.clean.vcf.gz -ExportPlugin -saveAs supergene.phy -format Phylip_Inter 做iqtree分析的时候，转换文件格式报错

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基因芯片探针与基因ID转化

  • ZLX 2023-07-29 16:31
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5 基因家族MCScanX共线性分析中是否把串联复制和大片段复制都筛出来了？

  • 2023-07-29 15:06
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各位老师好，我在使用geneid_to_mRNAid脚本提取自己基因组gff文件时报错了,但提取其他的是正常的,请问是怎么回事?

  • 2023-07-28 01:44
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LTR_retriever结果问题

  • 2023-07-27 23:13
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利用代码绘制共表达网络时，有一个聚类最多的基因颜色模块没有导入Cytoscape的两个文件，谢谢老师

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如何通过GWAS的曼哈顿图结果筛选基因？

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您好，关于随机森林那篇博文中的数据能够分享吗？

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老师您好，我想请问我的种源地不知道，要做群体遗传是不是先做个分子标记，鉴定一下亲缘关系，然后把亲缘关系近的剔除就可以做群体遗传了

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单克隆抗体和多克隆抗体的区别?单克隆抗体的制备过程是怎样的？

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请问种源地不清晰能够做群体遗传吗

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基因家族分析的蛋白结构预测，怎么比较预测的不同亚类蛋白3D结构的相似性？

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老师，您好，GWAS，PCA和结构分析时，总是运行代码显示segmentation fault, 以为是容量问题，按照提供的方案从4G提升到了10G，但是还是显示segmentation fault，网上说编译plink的系统和运行系统不一致，是这样吗？感觉不是容量的问题，电脑换了win10和11，都是这样，你们编译的代码

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GWAS分析中，PCA和群体结构分析，docker运行代码后最后均显示如下，segmentation fault，然后什么也不能生成，请问这是怎么回事

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sge投递任务，大约252000个job id后，投递任务状态一直是qw，不r了，这个可能什么原因呢

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3 在ncbi里转录组分析里的名称和Ensembl里检索的名称对应不上怎么办

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plantcare显示邮箱地址错误

  • 2023-07-17 17:59
1 解决

15 老师好，我购买了咱们的群体研究，请问如何计算vcf文件中某段范围内的纯合基因型（GT）频率？

  • Iron 2023-07-15 17:46