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老师您好，我在注释基因组重复序列时，使用repeatmasker、repeatmodeler、repeatproteinmas、trf注释完后，使用代码整合时出现重复序列比例大于100%，代码没有什么问题，请问还可能是什么原因导致的呢？

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老师您好，请问我在基因组重复序列注释，使用了repeatmasker、repeatmodeler、repeatproteinmas、TRF注释，然后使用代码整合到一起时，出现重复序列比例大于100%，代码没有问题，请问可能是什么原因导致的呢？

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做MCScanX共线性分析提取不了蛋白序列文件

  • 2023-05-12 10:39
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老师您好，我想用真菌线粒体基因组做群体遗传分析，已经组装好线粒体基因组，是需要把每个菌株自身的线粒体基因组当做ref还是用一个统一的线粒体基因组做ref?同时想请教也是按照重测序课程一个一个从线粒体基因组利用reads筛选snp么？

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老师您好，我想用真菌线粒体基因组做群体遗传分析，已经组装好线粒体基因组，是需要把每个菌株自身的线粒体基因组当做ref还是用一个统一的线粒体基因组做ref?同时想请教也是按照重测序课程一个一个从线粒体基因组利用reads筛选snp么？

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老师，我现在肠道菌群送检的数据有两个批次，用的引物序列不一样，在去除引物的操作中是分为两组去除吗，还是在一起去除两次，去除后如何合并两组处理后的数据

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docker toolbox启动报错

1 解决

获取不了基因与mRNA的对应关系

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你好老师，我是首次接触家族基因分析，数据从ncbi下载，想要转换一下格式，使用你的脚本，出现这个情况，该怎么办呀？

  • jay 2023-05-07 16:35
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病毒感染动物后进行皮肤组织二代测序，抽提质检发现28S/18S以及RIN都不合格，是什么原因？

  • 2023-05-07 15:35
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PSMC结果是一条直线

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各位老师，为什么我的Manhattan图做出来只有一列？

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转录组数据分析

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基因组组装（T2T）端粒问题

  • 2023-05-03 12:02
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SRAtookit下载总是报错

  • Yym 2023-05-02 16:28
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10 3D-DNA挂载的染色体如何chain文件

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如果interproscan数据库只指定小部分，对注释结果影响大吗？

  • 2023-04-30 21:34
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5 老师您好，MEGAX构建进化树的时候弹出这个窗口是什么意思，要怎么调整我的序列？

  • 2023-04-30 02:23
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请问用cytoscape能计算出交互作用网络modularity的值吗

  • ## 2023-04-28 16:37
1 解决

关于interproscan的问题

  • 2023-04-28 10:17