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GEO、TCGA多数据库联合挖掘胰腺导管腺癌预后关键基因

胰腺导管腺癌的五年生存率低于5%，是目前主要致死的癌症之一。如何结合多个公开数据库数据分析和挖掘此类癌症临床诊断和预后的关键基因呢？

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• Daitoue 发布于 2019-09-20 09:41

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GEO数据挖掘生物信息文章解读（拟南芥重金属）

GEO数据挖掘生物信息文章解读，动植物也可以发生信文章。

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• omicsgene 发布于 2019-08-11 11:01

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GEO和TCGA数据挖掘生物信息文章解读（宫颈癌）

GEO和TCGA数据挖掘生物信息文章解读（宫颈癌）

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• omicsgene 发布于 2019-07-29 14:37

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GEO数据挖掘生物信息文章解读（直肠癌）

GEO数据挖掘生物信息文章解读（直肠癌）

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• omicsgene 发布于 2019-07-26 14:52

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KM-plotter在线生存分析

KM-plotter在线生存分析

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• Daitoue 发布于 2019-04-04 13:28

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基于多数据集分析ANLN在宫颈癌所起到的功能

宫颈癌是造成女性死亡的主要癌症之一，这种妇科肿瘤发病也越来越年轻化。随着时代的发展和进步，我们能够从各大数据库网站找到开放的相关研究数据，包括GEO数据库、TCGA数据库等等。而基于现有...

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• Daitoue 发布于 2019-03-29 11:57

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判断GEO芯片数据是双通道还是单通道

GEO芯片数据芯片类型判断

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• Daitoue 发布于 2019-01-18 15:45

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芯片差异分析分组矩阵

芯片数据差异分析分组信息构建分组矩阵

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• Daitoue 发布于 2018-12-21 16:43

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WGCNA筛选Biomarker

Biomarker有助于疾病诊断、判断疾病分期或者用来评价新药或新疗法在目标人群中的安全性及有效性。基于WGCNA，对疾病相关的基因表达数据构建网络，鉴定关键模块和hub基因，是筛选Biomarker的有效...

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• Daitoue 发布于 2018-12-07 16:24

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GEO数据与WGCNA--挖掘胶质瘤共表达网络的关键模块与通路

加权基因共表达网络（WGCNA）可以利用基因表达数据，构建出加权的基因共表达网络，从而挖掘协同表达的基因模块，探索基因模块与性状之间的关系。 这种分析方法在生物研究领域中被广泛使用，以...

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• Daitoue 发布于 2018-11-23 12:45

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GEO数据库dataset和profiles区别

GEOdataset

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• omicsgene 发布于 2018-10-28 06:58

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TCGA和GEO套路文章解说

利用GEO数据TCGA数据筛选疾病相关标志分子，miRNA，mRNA，lncRNA，circRNA等；

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• omicsgene 发布于 2018-06-23 14:08

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如何将GEO芯片注释文件整理成GSEA能使用的芯片注释文件？

将GEO数据库中的注释文件整理成GSEA软件可以使用的芯片注释文件

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• landy 发布于 2018-06-22 15:01

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GEO数据芯片数据挖掘-在线工具分析GDS数据

自己没有数据，或者科研经费较少或者紧张，科研实验还要继续，利用GEO数据库筛选分子再做后续分析不失为一种经济而又快速的方法。本文详细讲解如何利用GEO数据库在线工具分析差异基因筛选全过程。

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• Daitoue 发布于 2018-06-21 17:31

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GEO在线分析工具--GEO2R进行基因差异表达分析

GEO2R是GEO在线分析工具，基于此工具可以对部分GEO样品数据进行基因差异表达分析。

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• Daitoue 发布于 2018-06-21 17:19