python版mcscan

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比较基因组学报错，如下图

  • dec. 2020-02-23 19:31:41
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mcscan作图时，染色体片段比较小，显示不出来怎么办？？请教

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mcscan_layout参数都是有关什么呢？求教

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基因组间的共线性分析为什么要对共线性区域进行过滤？

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python版本的MCScan出错，在画共线性图时

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比较基因组学构图（物种间共线性分析）时，anchors生成时，内容为空，但是其他的文件有内容。

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比较基因组学构图（物种间共线性分析时），手动生成两个配置文件时，再运行linux系统中的python绘图时出现这个问题，不知道是不是配置文件出现问题，我检查了bed文件的染色体命名时，没发现什么问题。ZeroDivisionError: float division by zero

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共线性 ZeroDivisionError: float division by zero

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MCsanX运行报错ZeroDivisionError: float division by zero

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你好！做基因家族分析，mcscan 做基因组间共线形关系，按课程做没有问题。用自己的数据，在绘制图片时显示如下图。配置文件如下图。文件夹内文件如下图。该如何处理？

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老师您好，在基因家族分析中，进行共线性分析绘图时，一直出现一下报错，麻烦老师帮忙解答一下

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/biosoft/miniconda/miniconda2/bin/python -m jcvi.compara.catalog ortholog ATH rapa --cscore=0.7 运行不下去，出现下面的情况，请问是不是我的python有问题？

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共线性分析出错

  • zhoy 2019-11-15 14:38:27
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Python 版mcscanx出现AttributeError: 'LayoutLine' object has no attribute 'order'

  • Frank 2019-10-30 17:34:17
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mac上如何安装和使用mcscan做共线性分析？

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