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代码报错

• GEO

• 佩奇学生信 2021-09-24 15:05:52

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老师您好，我这个是双通道芯片，我把read.maimages的所有source都试了一遍，还是不能把原始文件读进来

• GEO

• 乐毅1989 2021-05-01 18:05:37

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2643浏览

老师您好，我在进行GEO分析时，打开分组文件group_file时出现报错，请问我该如何解决？

• GEO

• 李承晔 2021-02-06 16:41:33

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请问老师，GEO数据分析时，运行gset = getGEO(GSE, GSEMatrix =TRUE, AnnotGPL=FALSE,destdir=workdir)时，遇到如图中报错，该如何处理呢？

• GEO

• 李承晔 2021-02-04 17:40:19

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Error in (function (classes, fdef, mtable) : unable to find an inherited method for function ‘bg.correct’ for signature ‘"HTAFeatureSet", "character"’

• GEO

• 张璐 2021-01-28 14:32:39

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安捷伦双色通道 “RawData=read.maimages(files=files,source="genepix") “报错”

• GEO

• lkjhg_mm 2021-01-23 22:08:50

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4511浏览

GEOquery 下载不了数据

• GEO

• Dominic 2020-12-24 11:33:55

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3282浏览

请问geo上的array数据是否可以用DESeq2做差异分析

• GEO

• 胖胖宋 2020-10-28 11:33:59

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4758浏览

GEOquery 下载不了数据

• GEO

• 新矛 2020-10-20 10:24:57

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5060浏览

有些GEO数据没发表论文/文章，可以拿来用吗？

• GEO

• 苏麟-WSL 2020-09-25 15:41:31

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5035浏览

老师，从GEO数据库下载的数据是标准化后的RNA-seq数据，能用哪个R包进行差异分析

• RNA-seq
• GEO

• ox 2020-07-27 11:05:52

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geo数据库中，双通道的矩阵与单通道的矩阵（均已标准化并取log值）都是可以进行WGCNA的吧，如果是的话，那两者的r语句应该是一样的吗？

• GEO
• WGCNA

• 小加伟 2020-07-23 21:11:35

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第一张图是geo直接下载的矩阵文件，是经校准的log数值，而在按照大讲堂标准化处理的课程，我标准化处理后形成的文件不是矩阵类型，而且每个基因的值是 “一串数字；个位数”的格式（如图二所示），请老师解释一下这种数值是什么意思，我应该如何转化成矩阵那样的数据呢？

• GEO

• 小加伟 2020-07-23 19:48:53

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3685浏览

老师您好，请问怎么从GEO中几万个基因数据中找出几千个想要的基因数据呢？或者我已经筛选出了差异表达基因，我怎么找到这些差异表达基因的具体数据？

• GEO

• 刘丽玲 2020-05-26 14:14:16

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8014浏览

怎么利用公开的转录组做基因家族的表达分析，还有GEO和SRA的区别是什么？

• GEO
• sra
• RNA-seq

• 拖延症晚期。 2020-04-27 22:29:15