暂无介绍
使用fastp软件对fastq文件进行剪切
筛选出能比对到参考序列的reads,形成新的fastq文件
想下载该篇文献中某一样品的fastq原始数据,看了一些下载教程,方法各异,看完思路还是不清晰,以下记录我的操作步骤,仅供参考
fastq文件转换成fasta 文件perl
给一个fastqID列表,输出指定ID对应的双端fastq文件:
fastqc质控报告查看
转换bam文件为fastq文件
bioperl同时读取双端的fastq文件
linux命令处理fasta序列
截取,反向互补,读入,写出,筛选等