mirdeep2 - 组学大讲堂问答社区

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预测miRNA前体

1. 寻找前体：将reads比对到参考基因组上。得到fa文件：对输入reads信息重新整理（将不同样本的reads重新整合到一起）；arf文件：比对结果。如果想增加比对结果，可以增加参数-q（比对错配数为1...

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rzx 发布于 2023-11-01 15:25

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在使用miRDeep进行miRNA预测的时候报错

运行命令：Rhi_mature.fa 是物种miRNA成熟序列；Rhi_hairpin.fa 是物种miRNA前体序列； perl otal_reads_collapsed_vs_genome.arf none -d -g 100000 -l 500 -m 11 -v -P -n d 报错： T...

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rzx 发布于 2023-09-05 13:27

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miRDeep2报错

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安生水发布于 2023-08-02 11:35

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mirDeep2的使用

miRNA的鉴定:利用miRDeep2软件进行已知及新（保守及非保守）的miRNA鉴定。miRDeep2会在reads比对到基因组上的位置两端分别延伸75、15bp进行结构预测。

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Morii 发布于 2021-01-08 16:38

预测miRNA前体

在使用miRDeep进行miRNA预测的时候报错

miRDeep2报错

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