GATK - 组学大讲堂问答社区

GATK

暂无介绍

2回答

8349浏览

合并gvcf的问题

米生花 2022-08-11 23:47:55

1回答

1855浏览

老师你好我在用gatk合并gvcf文件的时候系统提示有一个样本的gvcf文件某一行数据出现问题这种情况应该怎么解决是需要重新生成这个样本的gvcf文件吗？

St.Sky 2022-02-26 16:33:10

1回答

3323浏览

GATK HaplotypeCaller - Shutting down engine

omicsgene 2021-09-17 09:37:36

1回答

2640浏览

gatk报错：java.lang.IllegalStateException: Read position too high for BAI bin indexing.

omicsgene 2021-09-16 09:59:52

1回答

3476浏览

在SNPcalling结束后进行合并gvcf文件的时候发现文件里只有双亲的信心，核查发现两个子代的gvcf文件的表头中两个池的名字都是感亲的名字这个怎么修改

杨辉 2020-12-07 10:10:48

1回答

8552浏览

GATK中call SNP出来的SNP里面的ALT列出现 * 星号啥意思？

omicsgene 2020-02-25 11:05:34

1回答

9026浏览

GATK 建立压缩的VCF文件索引报错 IndexFeatureFile

omicsgene 2020-02-24 16:52:51

1回答

4229浏览

SNPcalling的方式有samtools结合bcftools，或者bcftools，或者gatk，三者之间有什么区别，那种方式更好一些

杨辉 2020-01-09 23:03:31

2回答

3789浏览

我在利用GATK进行SNPcalling前对bam文件进行Markduplication时，运行命令后，并没有生成去除重复reads后的bam文件，请问是什么原因？

杨辉 2019-12-14 13:46:47

1回答

3230浏览

-bash: SNP/S126-R132.HaplotypeCaller.log: No such file or directory

钱源 2019-09-03 15:31:28

1回答

3054浏览

a

钱源 2019-09-02 17:27:00