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gvcf

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老师，在生成gbcf文件后，发现只运行了前三个染色体的，是我的代码有问题嘛？该怎么解决啊？参考基因组的fasta，fai文件都是好的，前期生成的bam文件也是好的，样品是四倍体，参考基因组是异源四倍体

啊呀。 2024-10-25 18:12:20

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老师，我的db文件夹里显示了所有染色体都已经导入，但是在将gvcf转换成vcf时，发现在Lc2Ns染色体就结束完成了，这是正常现象嘛，是我使用的近源种参考基因组的原因嘛？我的是简化基因组测序的

啊呀。 2024-10-24 23:55:05

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老师，问题比较复杂，麻烦您看一下详细的问题描述，小麦基因组

啊呀。 2024-10-22 12:08:40

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老师，我有141个样品，现在IndexFeatureFile，tabix，bcftools都无法成功构建gvcf的索引，只有CSI格式能成功索引，这个格式在后续也用不了，这个gvcf索引还有其他的解决办法嘛，还是说我只能重新生成vcf文件了

啊呀。 2024-10-21 16:30:10

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按照您昨天提供的IndexFeatureFile 工具来构建gvcf文件索引时，依旧出现报错现象，无法索引，怎么办

啊呀。 2024-10-19 14:48:39

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成功得到了gvcf文件后，合并gvcf文件时，在导入db步骤中，由于gvcf文件超出了idx索引的处理范围，因此我使用CSI建立索引后，发现导入db的代码依旧无法运行，需要idx格式的索引，怎么办

啊呀。 2024-10-16 17:34:41

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老师，我按照多样本的代码生成gvcf文件后，发现并没有视频里讲解所说的tbi格式的索引文件，这是怎么回事呢，我需要怎么做啊

啊呀。 2024-10-15 18:43:50

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合并gvcf的问题

米生花 2022-08-11 23:47:55

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gvcf转vcf

Iron 2021-02-10 19:24:59