hclust - 组学大讲堂问答社区

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hclust_analysis.r 转录组数据层次聚类分析

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pheatmap 绘图出现报错信息类似： Error in hclust(d, method = method) : 外接函数调用时不能有NA/NaN/Inf(arg11)

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前面两篇文章介绍到pheatmap返回行和列的hclust结果： pheatmap返回的结果解释（获得新的排序信息） http://www.omicsclass.com/article/507 cutree对pheatmap返回结果实现聚类cluster划分 ...

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pheatmap是一个热图绘制的R包，全称pretty heatmap。利用的绘图函数是pheatmap()，对应的数据则是一个数值矩阵，譬如基于如下的矩阵10X6： > mat CK-WT-1 CK-WT-2 ...

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系统聚类Hierarchical clustering（层次聚类、谱系聚类）— 最短距离法（single linkage)— 最长距离法（complete linkage)— 中间距离法（median method)— 可变距离法（flexible median)— 重心...