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最近有审稿人问我们的SNP过滤标准的合理解释,这里总结一下相关的参考文献和标准的出处
VCF 是一种常用的生物信息学文件格式,用于存储基因组中的遗传变异数据,特别是单核苷酸多态性(SNP)和小插入/缺失(Indel)等变异。 VCF 文件通常由文本格式组成,可以用文本编辑器进行查看...
对vcf文件排序
格式转换
筛选VCF中指定位置变异位点
做过DNA重测序,群体遗传进化,BSA,GWAS等项目的人都会遇到VCF文件,这个文件记录了全基因组的变异信息,如果不懂VCF文件就无法进行后续分析。