群体遗传 - 组学大讲堂问答社区

群体遗传

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plink怎么设置样本的PPID，MID，Sex信息？

赵一琦 2024-04-20 09:47:03

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课程的IBD分析可以分析个体之间的IBD吗？计算得到的是IBD距离还是系数？想要通过IBD计算亲缘关系系数该如何操作？

赵一琦 2024-04-16 21:33:24

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做群体遗传分析，需要把indel提取出来嘛只用SNP的vcf文件？

红红火火 2023-12-08 10:12:24

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群体遗传课程admixture的问题

Biluhelumina 2023-09-11 16:36:19

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老师您好，我想用真菌线粒体基因组做群体遗传分析，已经组装好线粒体基因组，是需要把每个菌株自身的线粒体基因组当做ref还是用一个统一的线粒体基因组做ref?同时想请教也是按照重测序课程一个一个从线粒体基因组利用reads筛选snp么？

叶雪儿 2023-05-10 17:59:36

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老师您好，我想用真菌线粒体基因组做群体遗传分析，已经组装好线粒体基因组，是需要把每个菌株自身的线粒体基因组当做ref还是用一个统一的线粒体基因组做ref?同时想请教也是按照重测序课程一个一个从线粒体基因组利用reads筛选snp么？

叶雪儿 2023-05-10 17:57:59