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16S聚类还是降噪?
微生物多样性分析中最重要的就是OTU特征表,一切后续分析都围绕OTU表来进行。生成OTU除了聚类的方法,还有降噪的方法
OTUtable标准方法
MENA可以在线分析OTU互作网络(共现性网络) 可参考:http://www.omicsclass.com/article/68 或 微生物OTU网络图绘制(Cytoscape) MENA在完成构建网络(Construct the network)之后,可以对网...
微生物多样性分析中最基础、最重要的文件为OTU table,因此理解OTU table的含义和来路,对微生物多样性分析至关重要。本文介绍OTU table是怎么样一步一步得来的,及其注意事项。
16s测序数据除了进行常规的Alpha多样性分析,Beta多样性分析,以及PCA分析之外,还能做什么?