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请问如何合并VCF文件中同一样本的生物学重复信息

YANG_CNCX 2024-03-19 16:53:03

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老师您好，我用mutmap的方法分析了f2群体，有三个峰，有个一个峰在99阈值之上，但是做基因分分型时要么是突变体基因型要么是野生型基因型，而且区间前半段设计不出引物

管笑啸 2022-10-13 16:28:00

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基因变异的VCF文件除了染色体部分外的其他变异数据如何过滤？

呀哈哈 2022-09-27 10:33:36

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老师，我想问一下BSA分析实操课程中qtlplot这个命令是一个脚本吗 qtlplot -v qtlseq.RS-blast.clean.vcf.gz -r HitomeboreWT --bulk1ID S-bulk --bulk2ID R-bulk --N-bulk1 20 --N-bulk2 20 -m 0.3 --out qtlseq_SR-blast

dddddsss 2022-03-16 18:04:24

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老师好，请问课程bsa分析中，mutmap能同时输入两个子代混池吗？

菜兮 2021-12-28 13:17:59

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BSA数据在哪里下载呢？

大家好啊世界您好啊 2021-07-28 17:29:46

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老师就BSA分析中MutMap 分析：95% 99%阈值置信区间是如何计算的这个我还有点疑惑

刘孝伟 2021-07-20 14:21:02

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老师就 BSA分析中MutMap 分析：95% 99%阈值置信区间是如何计算的这个我还有点疑惑，https://www.omicsclass.com/article/1305就是这个网站里面的解答

刘孝伟 2021-07-20 13:52:14

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在QTL-seq分析的时候的vcf文件中双亲在后面，而子代双池在前面，这种怎么把顺序调整过来？有没有影响

杨辉 2021-02-21 21:45:32

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QTL-seq分析问题

乘121的猪 2020-08-04 20:18:05

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老师你们好，想问一下如何在自己服务器上下载docker

有我在 2020-07-20 10:34:49

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怎么利用BSA测序的数据的双亲和子代池的重测序数据设计KASP标记，有没有这方面的脚本可供学习,或者课程

杨辉 2020-07-17 10:31:57

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黄老师，怎么利用BSA测序的数据的双亲和子代池的重测序数据设计KASP标记，有没有这方面的脚本可供学习

杨辉 2020-07-13 22:23:04

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黄老师，我已获得BSA流程过滤后的snp的vcf文件，然后怎么利用这个文件绘制全部染色体的SNP-index的曼哈顿图

杨辉 2020-05-30 20:01:49

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BSA分析算法中利用ED算法进行分析，发现没有计算出来初定位的区间

杨辉 2019-11-15 20:42:15

请问如何合并VCF文件中同一样本的生物学重复信息

老师您好，我用mutmap的方法分析了f2群体，有三个峰，有个一个峰在99阈值之上，但是做基因分分型时要么是突变体基因型要么是野生型基因型，而且区间前半段设计不出引物

基因变异的VCF文件除了染色体部分外的其他变异数据如何过滤？

老师，我想问一下BSA分析实操课程中qtlplot这个命令是一个脚本吗 qtlplot -v qtlseq.RS-blast.clean.vcf.gz -r HitomeboreWT --bulk1ID S-bulk --bulk2ID R-bulk --N-bulk1 20 --N-bulk2 20 -m 0.3 --out qtlseq_SR-blast

老师好，请问课程bsa分析中，mutmap能同时输入两个子代混池吗？

BSA数据在哪里下载呢？

老师就BSA分析中MutMap 分析：95% 99%阈值置信区间是如何计算的这个我还有点疑惑

老师就 BSA分析中MutMap 分析：95% 99%阈值置信区间是如何计算的这个我还有点疑惑，https://www.omicsclass.com/article/1305就是这个网站里面的解答

在QTL-seq分析的时候的vcf文件中双亲在后面，而子代双池在前面，这种怎么把顺序调整过来？有没有影响

QTL-seq分析问题

老师你们好，想问一下如何在自己服务器上下载docker

怎么利用BSA测序的数据的双亲和子代池的重测序数据设计KASP标记，有没有这方面的脚本可供学习,或者课程

黄老师，怎么利用BSA测序的数据的双亲和子代池的重测序数据设计KASP标记，有没有这方面的脚本可供学习

黄老师，我已获得BSA流程过滤后的snp的vcf文件，然后怎么利用这个文件绘制全部染色体的SNP-index的曼哈顿图

BSA分析算法中利用ED算法进行分析，发现没有计算出来初定位的区间

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