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GATK call SNP
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老师,您好,我在运行gatk的HaplotypeCaller时,因为样本过多(二三百个样本),运行成功的单个样本运行了24+个小时,尝试了采用ParaFly工具多任务并行,并且也尝试了同时运行多个nohup sh gatk.g.sh > gatk.g.sh.o&(一个gatk.g.sh对应一个样本),但是都是在十几分钟后终止进程了,查看了其中一个gatk.g.sh.o文件,文件内容如下,烦请老师帮忙提出问题及解决方法,非常感谢
GATK call SNP
Evening
2024-10-21 15:59:20
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