GFF - 组学大讲堂问答社区

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GFF或GTF格式转bed

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安生水发布于 2024-03-14 14:02

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gbff 格式注释文件转换成gff3注释文件格式

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生信阿姨发布于 2023-04-06 18:08

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解决基因组当中蛋白质序列ID和gff中ID不一致的问题

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omicsgene 发布于 2023-04-06 09:38

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根据GFF文件提取基因组中基因的蛋白，CDS，CDNA序列

https://github.com/TransDecoder/TransDecoder

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omicsgene 发布于 2022-12-28 11:52

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GFF文件格式不标准，第三列只有GENE处理方法

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omicsgene 发布于 2020-11-14 09:41

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GFF文件格式不标准，第三列只有mRNA处理方法

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omicsgene 发布于 2019-05-07 15:48

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从gff文件当中提取对应转录本ID的基因结构信息用于GSDS绘制结构图脚本更新

get_gene_exon_from_gff.pl 脚本更新，

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omicsgene 发布于 2019-03-15 13:34

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GFF中提取所有转录本的位置信息，以及对应的基因ID信息；

提取基因的转录本信息，以及对应的基因ID；

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omicsgene 发布于 2018-12-13 22:33

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perl输出基因的位置信息按照基因所在染色体，和位置信息排序

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omicsgene 发布于 2018-12-13 22:26

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GFF与GTF格式转换

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安生水发布于 2018-08-10 11:53

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GFF3格式说明

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安生水发布于 2018-07-20 12:01

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如何将基因组的注释文件gff转化成基因的注释文件gtf

在做分析的时候，有时候我们需要将gff文件转化为gtf，如何转化呢？这里有一个小工具，虚拟机的bio-linux自带不需要安装，就是gffread：命令行格式：gffread gff文件 -T -o gtf文件，...

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landy 发布于 2018-05-11 10:55

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两分钟看懂基因组注释GFF文件

随着大数据时代的到来，很多生物科研工作者都接触了基因组相关实验。在做数据分析的时候，会用到一个很重要的文件，就是基因组的注释文件，也就是今天分享内容的主角GFF文件！什么是GFF文件...

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landy 发布于 2018-04-22 21:00