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Cytoscape 是一个专注于开源网络可视化和分析的软件。它的核心是提供基础的功能布局和查询网络,并依据基本的数据的结合成可视化网络。
cytoscape-cytoHubba插件的安装与使用
cytoscape绘制蛋白互作网络图
在利用Cytoscape绘图的过程中如何对具有不同属性(分类)的点(以及与该点相连的线)进行颜色着色呢? 譬如下图 显示了miRNA 和靶基因的相互作用,并基于靶基因的类型对网网络图进行了颜色处理...
复杂网络(可参考维基百科Complex network、Network theory)由多个基本单元( 或节点) 与它们之间的相互作用( 即连线) 组成,典型的例子有互联网、神经网络和各类生物网络(包括代谢网络、基因调...
cytoscape插件BinGO安装以及GO富集分析和网络可视化
有学员反映在学习GEO芯片数据挖掘,进行利用差异基因进行蛋白质互作网络分析的过程中,获得的info文件中之涉及了String_id,利用Cytoscape进行绘图的过程中无法知道对应的具体基因ID是什么...
16s测序数据除了进行常规的Alpha多样性分析,Beta多样性分析,以及PCA分析之外,还能做什么?
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